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Enregistrement W2179348799 · doi:10.1128/mbio.00729-15

The Relationship between Microbial Community Evenness and Function in Slow Sand Filters

2015· article· en· W2179348799 sur OpenAlexaff
Sarah–Jane Haig, Christopher Quince, Robert L. Davies, Caetano C. Dorea, Gavin Collins

Notice bibliographique

RevuemBio · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWater Treatment and Disinfection
Établissements canadiensUniversité LavalInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research CouncilMedical Research CouncilUniversity of Glasgow
Mots-clésSpecies evennessMicrobial population biologyEnvironmental scienceWater qualityBiologySand filterEcologyEnvironmental engineeringSpecies diversityBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

UNLABELLED: Two full-scale slow sand filters (SSFs) were sampled periodically from April until November 2011 to study the spatial and temporal structures of the bacterial communities found in the filters. To monitor global changes in the microbial communities, DNA from sand samples taken at different depths and locations within the SSFs and at different filters ages was used for Illumina 16S rRNA gene sequencing. Additionally, 15 water quality parameters were monitored to assess filter performance, with functionally relevant microbial members being identified by using multivariate statistics. The bacterial diversity in the SSFs was found to be much larger than previously documented, with community composition being shaped by the characteristics of the SSFs (filter age and depth) and sampling characteristics (month, side, and distance from the influent and effluent pipes). We found that several key genera (Acidovorax, Halomonas, Sphingobium, and Sphingomonas) were associated with filter performance. In addition, at the whole-community level, a strong positive correlation was found between species evenness and filter performance. This study is the first to comprehensively characterize the microbial community of SSFs and link specific microbes to water quality parameters. In doing so, we reveal key patterns in microbial community structure that relate to overall community function. IMPORTANCE: The supply of sustainable, energy-efficient, and safe drinking water to an increasing world population is a huge challenge faced by the water industry. SSFs have been used for hundreds of years to provide a safe and reliable source of potable drinking water, with minimal energy requirements. However, a lack of knowledge pertaining to the treatment mechanisms, particularly the biological processes, underpinning SSF operation has meant that SSFs are still operated as "black boxes." Understanding these dynamics alongside performance-induced effects associated with operational differences will promote optimized SSF design, maintenance, and operation, creating more efficient and environmentally sustainable filters. Through a spatial-temporal survey of full-scale SSFs at various points of operation, we present the most detailed characterization to date of the functional microbial communities found in SSFs, linking various taxa and community metrics to optimal water quality production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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