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Enregistrement W2179619487 · doi:10.1128/9781555817107.ch17

Autoinducer 2‐Regulated Genes in<i>Streptococcus mutans</i>and Impact on Oral Bacterial Communities

2011· other· en· W2179619487 sur OpenAlexaff
Julie Perry, Dennis G. Cvitkovitch

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmQuorum sensingStreptococcus mutansBiologyVibrio harveyiOrganismAutoinducerGeneMicrobiologySignal transductionGlucosyltransferaseGeneticsCell biologyVibrioBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter explores the mechanism of interspecies cell-cell communication in the oral biofilm, with emphasis on the cariogenic organism Streptococcus mutans. Bioluminescence in the marine organism Vibrio harveyi was one of the first examples of quorum sensing behavior described to occur in nature. The gene required for autoinducer 2 (AI-2) production encodes the enzyme LuxS, which functions in the S-adenosylmethionine (SAM) utilization pathway. Biofilms are complex communities where close interactions between heterogeneous species are common. Alterations in AI-2 signaling might affect biofilm formation in several ways, and changes in the cells themselves during the physiologically distinct biofilm mode of growth might reciprocally affect AI-2 signaling. Exopolysaccharide (EPS) production occurs after attachment and is involved in the latter stages of biofilm maturation. The genetic basis for altered biofilm structure in S. mutans luxS mutants has been attributed to an overexpression of the general stress response genes encoding GroEL and DnaK or to increased glucosyltransferase expression. The majority of genes found to respond to the AI-2 signal were genes involved in protein synthesis and genes for hypothetical proteins. A convincing demonstration of S. mutans complementing a luxS deletion in another species would be helpful in establishing the true nature of this signal. Interference with AI-2-mediated signaling occurs between competing microorganisms that share the same niche.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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