Genetic Diversity of Indigenous Bacillus thuringiensis Strains by RAPD-PCR to Combat Pest Resistance
Notice bibliographique
Résumé
Genetic diversity is highly relevant and significant in discovering novel insecticidal genes in Bacillus thuringiensis ( Bt ) strains and to deal with the problems of emerging insect resistance towards Bt biopesticides. In view of this, Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)-PCR analysis was performed with a decamer AGCTCAGCCA for molecular typing of 177 Bt strains of Bangladesh to determine their genetic diversity. These Bt strains were allocated into 15 genomic types with their binary matrices as determined from the dendrogram based on a standardized distance in scale bar. Genotype 9 and 11 were the largest among others, each containing more than 25% of the Bt strains. The average diversity index, as deduced for each group by cluster: isolate ratio at a specific distance, was higher for locations (0.27 ± 0.098) than that for biotypes (0.23 ± 0.046) which indicates an unmingled and vertical transfer of biochemical properties among the strains. Prevalence of agriculturally important subgroups of cry1 gene in indigenous Bt strains was also determined where cry1Aa and cry1Ca gene were found to be the most prevalent (21.74%). While analyzing the distribution pattern of cry genes, they were observed to be present in all RAPD- genotypes but genotype 10 and were most prevalent in genotypes 1, 6 and 9. The phylogeny reconstruction among the strains was performed by neighbor-joining method with the 16S rRNA gene sequences and the correlation among the phylogeny, RAPD genotypes, Biotypes and presence of cry genes were analyzed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».