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Enregistrement W2180555057 · doi:10.3109/03008207.2015.1099636

Association study of MMP8 gene in osteoarthritis

2015· review· en· W2180555057 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueConnective Tissue Research · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBiomedicum Helsinki-säätiöOtto A. Malm LahjoitusrahastoSuomen KulttuurirahastoEmil Aaltosen SäätiöMonash University
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMedicineOsteoarthritisMeta-analysisCohortInternal medicineSNPAlleleCohort studyGeneticsOncologyGenotypeBioinformaticsGeneBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Osteoarthritis (OA) is a joint disease common in the elderly. There is a prior functional evidence for different matrix metalloproteinases (MMPs), such as MMP8 and MMP9, having a role in the breakdown of cartilage extracellular matrix in OA. Thus, we analyzed whether the common genetic variants of MMP8 and MMP9 contribute to the risk of OA. MATERIALS AND METHODS: In total, 13 common tagging single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were studied in a discovery knee OA cohort of 185 cases and 895 controls. For validation, two knee OA replication cohorts and two hand OA replication cohorts were studied (altogether 1369 OA cases, 4445 controls in the five cohorts). The χ(2) test for individual study cohorts and Cochran-Mantel-Haenszel test for combined meta-analysis were calculated using Plink. RESULTS: The rs1940475 SNP in MMP8 showed suggestive association in the discovery cohort (OR = 0.721, 95% CI 0.575-0.906; p = 0.005). Other knee and hand OA replication study cohorts showed similar trend for the predisposing allele without reaching statistical significance in independent replication cohorts nor in their meta-analysis (p > 0.05). Meta-analysis of all five hand and knee OA study cohorts yielded a p-value of 0.027 (OR = 0.904, 95% CI 0.826-0.989). CONCLUSIONS: Initial analysis of the MMP8 gene showed suggestive association between rs1940475 and knee OA, but the finding did not replicate in other study cohorts, even though the trend for predisposing allele was similar in all five cohorts. MMP-8 is a good biological candidate for OA, but our study did not find common variants with significant association in the gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,213
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle