Cloning and differential expression of a plum single repeat-MYB,<i>PdMYB3</i>, in compatible and incompatible interactions during fungal infection
Notice bibliographique
Résumé
El-kereamy, A. and Jayasankar, S. 2013. Cloning and differential expression of a plum single repeat-MYB, PdMYB3, in compatible and incompatible interactions during fungal infection. Can. J. Plant Sci. 93: 599–605. Enhancing resistance to pathogen attack through conventional breeding is a major challenge, especially in perennial species. Monilinia fructicola fungal infection causes brown rot disease, resulting in economic damage of stone fruits at flowering, pre- and post-harvest stages. The molecular mechanism of resistance to this disease is still not known. In the present study, we cloned and analyzed the expression of a novel MYB transcription factor from European plums (PdMYB3) induced in response to M. fructicola fungal infection. The identified PdMYB3 is a single repeat-MYB protein that contains a conserved SHAQKYF motif. Monilinia fructicola infection induces the expression of PdMYB3 in fruits of four cultivars within 24 h; however, it is differentially expressed in the susceptible and resistant varieties. By comparing four different cultivars we found that PdMYB3 is induced in much higher levels in the susceptible cultivars than the resistant ones. In addition the PdMYB3 expression is higher in the early stages of fruit development prior to pit hardening, suggesting a potential role for PdMYB3 during this stage. Promoter analysis revealed the presence of some hormone cis-elements suggesting a possible role for PdMYB3 gene in transmitting a signal from the hormonal pathways to downstream components during host-pathogen interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».