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Enregistrement W2181535335 · doi:10.4141/cjps2013-009

Cloning and differential expression of a plum single repeat-MYB,<i>PdMYB3</i>, in compatible and incompatible interactions during fungal infection

2013· article· en· W2181535335 sur OpenAlexaffvenue
Ashraf El‐Kereamy, Jayasankar Subramanian

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMYBMonilinia fructicolaGenePathogenCultivarTranscription factorPlant disease resistanceCloning (programming)GeneticsGene expressionWRKY protein domainBotanyTranscriptomePostharvest

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

El-kereamy, A. and Jayasankar, S. 2013. Cloning and differential expression of a plum single repeat-MYB, PdMYB3, in compatible and incompatible interactions during fungal infection. Can. J. Plant Sci. 93: 599–605. Enhancing resistance to pathogen attack through conventional breeding is a major challenge, especially in perennial species. Monilinia fructicola fungal infection causes brown rot disease, resulting in economic damage of stone fruits at flowering, pre- and post-harvest stages. The molecular mechanism of resistance to this disease is still not known. In the present study, we cloned and analyzed the expression of a novel MYB transcription factor from European plums (PdMYB3) induced in response to M. fructicola fungal infection. The identified PdMYB3 is a single repeat-MYB protein that contains a conserved SHAQKYF motif. Monilinia fructicola infection induces the expression of PdMYB3 in fruits of four cultivars within 24 h; however, it is differentially expressed in the susceptible and resistant varieties. By comparing four different cultivars we found that PdMYB3 is induced in much higher levels in the susceptible cultivars than the resistant ones. In addition the PdMYB3 expression is higher in the early stages of fruit development prior to pit hardening, suggesting a potential role for PdMYB3 during this stage. Promoter analysis revealed the presence of some hormone cis-elements suggesting a possible role for PdMYB3 gene in transmitting a signal from the hormonal pathways to downstream components during host-pathogen interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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