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Enregistrement W2181676853 · doi:10.3897/asp.72.e31897

DNA barcoding of flat bugs (Hemiptera: Aradidae) with phylogenetic implications

2014· article· en· W2181676853 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueArthropod Systematics & Phylogeny · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHemiptera Insect Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGovernment of CanadaOntario GenomicsUniversity of GuelphOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésPolyphylyBiologyParaphylyMonophylyDNA barcodingSister groupZoologyEvolutionary biologyCladeGenusSubfamilyPhylogenetic treeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This work introduces an open online library of Aradidae DNA barcodes, specimen images and geographical data with intent of promoting further community-based DNA barcoding of flat bugs. We report the results of an attempt to DNA barcode 191 dry specimens of the flat bugs representing all 8 extant subfamilies of the Aradidae. 145 sequences > 300 nt in length were obtained (76% success rate; all can be seen in a publicly accessible dataset “World Aradidae”, doi: dx.doi.org/10.5883/DS-WAHG), 98 of them representing 55 species and 29 genera were > 500 nt (51%). These 98 sequences were combined with 10 Heteroptera-Trichophora outgroup taxa into an aligned matrix of 658 positions and variously analysed to obtain the first DNA-based phylogeny for the Aradidae, which was our second goal. Aradidae and five of its subfamilies (Aradinae, Aneurinae, Mezirinae, Isoderminae, Calisiinae) were recovered as monophyletic, although the latter two were markedly underrepresented. The subfamily Carventinae was consistently polyphyletic. Isoderminae + Prosympiestinae was recovered as a clade, while Aradinae formed the sister group to the rest of the family in three of four analyses. The genus Mezira appeared polyphyletic while the genus Neuroctenus was paraphyletic with respect to Ctenoneurus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,719
Score d'incertitude au seuil0,441

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle