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Enregistrement W2182422225 · doi:10.4141/cjps2011-101

A reproducible assay for measuring partial resistance to <i>Sclerotinia sclerotiorum</i> in soybean

2012· article· en· W2182422225 sur OpenAlexafffundvenueabout
Maxime Bastien, Tung Thanh Huynh, Geneviève Giroux, Elmer Iquira, S. Rioux, François Belzile

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensGrain Research CentreUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSclerotinia sclerotiorumSclerotiniaStem rotBiologyCultivarInoculationMyceliumHorticultureAgronomyQuantitative trait locusInbred strainGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bastien, M., Huynh, T. T., Giroux, G., Iquira, E., Rioux, S. and Belzile, F. 2012. A reproducible assay for measuring partial resistance to Sclerotinia sclerotiorum in soybean. Can. J. Plant Sci. 92: 279–288. In eastern Canada, Sclerotinia stem rot in soybean is an important disease, and resistance is systematically assessed in cultivar performance trials. The reference method used in these trials closely mimics the natural infection process, but is very demanding, and its success is highly subject to environmental conditions. Here we describe a simple, quick and reproducible inoculation method to measure resistance to pathogen progression on the main stem. Importantly, this method is the first to reproducibly identify quantitative trait loci (QTLs) conferring partial resistance to Sclerotinia stem rot in soybean. In this method, a cotton pad saturated with a mycelial suspension is applied to a floral bud and resistance is estimated by measuring lesion length on the main stem. The method was found to discriminate clearly between known resistant and susceptible checks in both the field and greenhouse. Clear discrimination between 26 recombinant inbred lines (RILs) contrasted for QTLs controlling resistance to Sclerotinia stem rot was also achieved in four independent trials, and lesion length was significantly correlated among all trials. When tested on 38, 42 and 40 lines in registration trials, the results of this method were significantly correlated with those of the reference method in 2 of 3 yr.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,718
Score d'incertitude au seuil0,900

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2012
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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