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Enregistrement W2183316119 · doi:10.1371/journal.pmed.1001908

Use of Viremia to Evaluate the Baseline Case Fatality Ratio of Ebola Virus Disease and Inform Treatment Studies: A Retrospective Cohort Study

2015· article· en· W2183316119 sur OpenAlexafffund
Oumar Faye, Alessio Andronico, Ousmane Faye, Henrik Salje, Pierre‐Yves Boëlle, N’Faly Magassouba, Elhadj Ibrahima Bah, Lamine Koivogui, Boubacar Diallo, Alpha Amadou Diallo, Sakoba Keïta, Mandy Kader Kondé, Robert Fowler, Gamou Fall, Simon Cauchemez, Amadou Alpha Sall

Notice bibliographique

RevuePLoS Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesAXA Research FundAgence Nationale de la RechercheEuropean CommissionWorld Health OrganizationHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésViremiaMedicineCase fatality rateOdds ratioInternal medicineEpidemiologyRetrospective cohort studyViral loadEbola virusCohortOutbreakImmunologyVirologyDiseaseVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The case fatality ratio (CFR) of Ebola virus disease (EVD) can vary over time and space for reasons that are not fully understood. This makes it difficult to define the baseline CFRs needed to evaluate treatments in the absence of randomized controls. Here, we investigate whether viremia in EVD patients may be used to evaluate baseline EVD CFRs. METHODS AND FINDINGS: We analyzed the laboratory and epidemiological records of patients with EVD confirmed by reverse transcription PCR hospitalized in the Conakry area, Guinea, between 1 March 2014 and 28 February 2015. We used viremia and other variables to model the CFR. Data for 699 EVD patients were analyzed. In the week following symptom onset, mean viremia remained stable, and the CFR increased with viremia, V, from 21% (95% CI 16%-27%) for low viremia (V < 104.4 copies/ml) to 53% (95% CI 44%-61%) for intermediate viremia (104.4 ≤ V < 105.2 copies/ml) and 81% (95% CI 75%-87%) for high viremia (V ≥ 105.2 copies/ml). Compared to adults (15-44 y old [y.o.]), the CFR was larger in young children (0-4 y.o.) (odds ratio [OR]: 2.44; 95% CI 1.02-5.86) and older adults (≥ 45 y.o.) (OR: 2.84; 95% CI 1.81-4.46) but lower in children (5-14 y.o.) (OR: 0.46; 95% CI 0.24-0.86). An order of magnitude increase in mean viremia in cases after July 2014 compared to those before coincided with a 14% increase in the CFR. Our findings come from a large hospital-based study in Conakry and may not be generalizable to settings with different case profiles, such as with individuals who never sought care. CONCLUSIONS: Viremia in EVD patients was a strong predictor of death that partly explained variations in CFR in the study population. This study provides baseline CFRs by viremia group, which allow appropriate adjustment when estimating efficacy in treatment studies. In randomized controlled trials, stratifying analysis on viremia groups could reduce sample size requirements by 25%. We hypothesize that monitoring the viremia of hospitalized patients may inform the ability of surveillance systems to detect EVD patients from the different severity strata.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,838

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,241
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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