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Enregistrement W2183868793 · doi:10.2337/db15-1313

Genome-wide Association Studies Identify Genetic Loci Associated With Albuminuria in Diabetes

2015· article· en· W2183868793 sur OpenAlexafffund
Alexander Teumer, Adrienne Tin, Rossella Sorice, Mathias Gorski, Nan Cher Yeo, Audrey Y. Chu, Man Li, Yong Li, Vladan Mijatovic, Yi-An Ko, Daniel Taliun, Alessandro Luciani, Ming‐Huei Chen, Qiong Yang, Meredith C. Foster, Matthias Olden, Linda T. Hiraki, Bamidele O. Tayo, Christian Fuchsberger, Aida Karina Dieffenbach, Alan R. Shuldiner, Albert V. Smith, Allison Zappa, Antonio Lupo, Barbara Kollerits, Belén Ponte, Bénédicte Stengel, Bernhard K. Krämer, Bernhard Paulweber, Braxton D. Mitchell, Caroline Hayward, Catherine Helmer, Christa Meisinger, Christian Gieger, Christian M. Shaffer, Christian Müller, Claudia Langenberg, Daniel Ackermann, David S. Siscovick, Eric Boerwinkle, Florian Kronenberg, Georg Ehret, Georg Homuth, Gérard Waeber, Gerjan Navis, Giovanni Gambaro, Giovanni Malerba, Guðný Eiríksdóttir, Li Guo, H.-Erich Wichmann, Harald Grallert, Henri Wallaschofski, Henry Völzke, Hermann Brenner, Holly Kramer, Irene Mateo Leach, Igor Rudan, Hans L. Hillege, J. Beckmann, Jean‐Charles Lambert, Jian’an Luan, Jing Zhao, John Chalmers, Josef Coresh, Joshua C. Denny, Katja Butterbach, Lenore J. Launer, Luigi Ferrucci, Lyudmyla Kedenko, Margot Haun, Marie Metzger, Mark Woodward, Matthew Hoffman, Matthias Nauck, Mélanie Waldenberger, Menno Pruijm, Murielle Bochud, Myriam Rheinberger, Niek Verweij, Nicholas J. Wareham, Nicole Endlich, Nicole Soranzo, Ozren Polašek, Pim van der Harst, Peter P. Pramstaller, Péter Vollenweider, Philipp S. Wild, Ron T. Gansevoort, Rainer Rettig, Reiner Biffar, Robert J. Carroll, Ronit Katz, Ruth J. F. Loos, Shih‐Jen Hwang, Stefan Coassin, Sven Bergmann, Sylvia E. Rosas, Sylvia Stracke, Tamara B. Harris, Tanguy Corre, Tanja Zeller, Thomas Illig, Thor Aspelund, Toshiko Tanaka, Uwe Lendeckel, Uwe Völker, Vilmundur Guðnason, Vincent Chouraki, Wolfgang Köenig, Zoltán Kutalik, Jeffrey R. O’Connell, Afshin Parsa, Iris M. Heid, Andrew D. Paterson, Ian H. de Boer, Olivier Devuyst, Jozef Lazar, Karlhans Endlich, Katalin Suszták, Johanne Tremblay, Pavel Hamet, Howard J. Jacob, Carsten A. Böger, Caroline S. Fox, Cristian Pattaro, Anna Köttgen

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalPublic Health OntarioUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on Drug AbuseNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilNational Institute on AgingDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institutes of HealthCancer Research UK
Mots-clésAlbuminuriaGenome-wide association studyDiabetes mellitusGenetic associationGeneticsMedicineAssociation (psychology)BiologyComputational biologyBioinformaticsSingle-nucleotide polymorphismEndocrinologyGenotypeGenePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated concentrations of albumin in the urine, albuminuria, are a hallmark of diabetic kidney disease and are associated with an increased risk for end-stage renal disease and cardiovascular events. To gain insight into the pathophysiological mechanisms underlying albuminuria, we conducted meta-analyses of genome-wide association studies and independent replication in up to 5,825 individuals of European ancestry with diabetes and up to 46,061 without diabetes, followed by functional studies. Known associations of variants in CUBN, encoding cubilin, with the urinary albumin-to-creatinine ratio (UACR) were confirmed in the overall sample (P = 2.4 × 10(-10)). Gene-by-diabetes interactions were detected and confirmed for variants in HS6ST1 and near RAB38/CTSC. Single nucleotide polymorphisms at these loci demonstrated a genetic effect on UACR in individuals with but not without diabetes. The change in the average UACR per minor allele was 21% for HS6ST1 (P = 6.3 × 10(-7)) and 13% for RAB38/CTSC (P = 5.8 × 10(-7)). Experiments using streptozotocin-induced diabetic Rab38 knockout and control rats showed higher urinary albumin concentrations and reduced amounts of megalin and cubilin at the proximal tubule cell surface in Rab38 knockout versus control rats. Relative expression of RAB38 was higher in tubuli of patients with diabetic kidney disease compared with control subjects. The loci identified here confirm known pathways and highlight novel pathways influencing albuminuria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,871

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations163
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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