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Enregistrement W2183951168 · doi:10.11646/zootaxa.2812.1.1

Mitochondrial diversity of the white-toothed shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Crocidura) in Vietnam

2011· article· en· W2183951168 sur OpenAlexaff
А. А. Банникова, Alexei V. Abramov, Alex Borisenko, Vladimir S. Lebedev, В. В. Рожнов

Notice bibliographique

RevueZootaxa · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZoologyCytochrome bShrewGenetic diversityGenetic distanceMitochondrial DNAEcologyPopulationGenetic variationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We explored the patterning of genetic diversity within white-toothed shrews of the genus Crocidura from 14 localities across Vietnam. An analysis of cytochrome oxidase c subunit I (COI) and cytochrome b (cytb) gene fragments from 185 specimens of white-toothed shrews of the genus Crocidura from 14 localities across Vietnam revealed six deeply divergent (p-distance for both COI and cytb >10%) lineages, corresponding to the morphological species C. sokolovi, C. zaitsevi, C. phuquocensis, С . indochinensis, C. tanakae and, C. phanluongi. Crocidura sokolovi was distinct from all other Vietnamese white-toothed shrews (~13% on average for both cytb and COI). In addition to demonstrating the genetic separation of previously described species, substantial cryptic genetic diversity was revealed. Crocidura zaitsevi and C. tanakae each included two subgroups that corresponded to geographically remote localities, while C. indochinensis contained two distinct subgroups that exhibited co-varying patterns of morphological and ecological differentiation, suggesting that the individuals from Sa Pa represent a separate species (provisionally named Crocidura sp. AB1). Mitochondrial data generated for the type specimens of C. phanluongi from Yok Don and Bu Gia Map supported the validity of the species while an additional specimen from Binh Chau, South Vietnam originally referred to C. phanluongi exhibited a deep genetic split (cytb: 8.4%; COI: 8.7%) from a neighbouring population in Yok Don. We propose that the specimen from Binh Chau also represents an undescribed species (provisionally named Crocidura sp. AB2). Our cytb data were then compared to the sequences of 28 species of Crocidura from Southeast Asia available in GenBank, suggesting that three more species occur in northern Vietnam, namely C. wuchihensis, C. attenuata and C. fuliginosa/C. dracula. The discovery of fairly deep genetic divergences among Vietnamese Crocidura illustrates that the understudied and largely undescribed diversity of white-toothed shrews in Southeast Asia requires deeper scrutiny. It also shows the useful insights of mitochondrial markers as to the taxonomic resolution of this enigmatic group of mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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