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Enregistrement W2184090721

Epigenetic anomalies associated with prenatal survival and neonatal morbidity in cloned calves

2010· article· en· W2184090721 sur OpenAlexaff
Lawrence C. Smith, J Suzuki, A.K. Goff, France Filion, Jacinthe Therrien, Bruce D. Murphy, Hamid‐Reza Kohan‐Ghadr, Réjean Lefebvre, A.‐C. Brisville, Sébastien Buczinski, G. Fecteau, Felipe Perecin, Flávio Vieira Meirelles

Notice bibliographique

RevueAnimal Reproduction · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySomatic cell nuclear transferGenomic imprintingEpigeneticsGeneticsEmbryoDNA methylationAndrologyGeneOffspringAlleleBlastocystEmbryogenesisGene expressionPregnancy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many of the developmental anomalies observed in cloned animals are related to fetal and placental overgrowth, a phenomenon known as the “large offspring syndrome” (LOS) in ruminants. It has been hypothesized that the epigenetic control of imprinted genes, i.e. genes that are expressed in a parental-specific manner, is at the root of LOS. Our recent research has focused on understanding the epigenetic alterations to imprinted genes that are associated with assisted reproductive technologies (ART), such as early embryo in vitro culture (IVC) and somatic cell nuclear transfer (SCNT) in cattle. We have searched and identified single nucleotide polymorphisms in Bos indicus DNA useful for analysis of parental-specific alleles and their respective transcripts in tissues from hybrid embryos derived by crossing Bos indicus and Bos taurus cattle. Due to the frequency of placental anomalies in SCNT and in some IVC gestations, our initial studies focused on genes known to be necessary for trophoblast proliferation (Mammalian Achaete Scute-like Homologue 2; ASCL2) and differentiation (Heart and neural crest cell derivative 1; HAND1). ASCL2 was bi-allelically expressed prior to implantation but paternally silenced after implantation. At day 17, SCNT embryos showed more abundant ASCL2 and less abundant HAND1 transcripts. After implantation, SCNT fetal cotyledons displayed higher ASCL2 and HAND1 than AI and IVC tissues. To further investigate epigenetic anomalies, we analyzed the differentially methylated regions of other imprinted genes in cattle, i.e. SNRPN, H19 and the IGF2R. Compared with the patterns observed in vivo (AI), we observed a generalized hypomethylation of the imprinted allele and the bi-allelic expression of embryos produced by SCNT. Together, these results indicate that imprinting marks are erased during the reprogramming of the somatic cell nucleus during early development, indicating that such epigenetic anomalies may play a key role in the mortality and morbidity of cloned animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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