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Enregistrement W2184511185 · doi:10.1002/ece3.1850

Genetic differentiation of the regional <i>Plutella xylostella</i> populations across the Taiwan Strait based on identification of microsatellite markers

2015· article· en· W2184511185 sur OpenAlexaff
Fushi Ke, Shijun You, Weiyi He, Tiansheng Liu, Liette Vasseur, Carl J. Douglas, Minsheng You

Notice bibliographique

RevueEcology and Evolution · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensBrock UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDiamondback mothMicrosatelliteGenetic structureBiologyPlutellaPEST analysisPopulationGene flowEcologyGenetic diversityEvolutionary biologyLepidoptera genitaliaGenetic variationGeneticsBotanyDemographyGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Movement of individuals through events, such as storms or crop transportation, may affect survival and distribution of insect pests, as well as population genetic structure at a regional scale. Understanding what factors contribute to gene flow in pest populations remains very important for sustainable pest management. The diamondback moth (Plutella xylostella) is an insect pest well known for its capacity of moving over short to long distances. Here, we used newly isolated microsatellite markers to analyze the genetic structure of nine populations across the Taiwan Strait of China (Taiwan and Fujian). A total of 12,152 simple sequence repeats (SSRs) were initially identified from the P. xylostella transcriptome (~94 Mb), with an average of 129 SSRs per Mb. Nine SSRs were validated to be polymorphic markers, and eight were used for this population genetic study. Our results showed that the P. xylostella populations could be divided into distinct two clusters, which is likely due to the year-round airflows in this region. A pattern of isolation by distance among the local populations within Fujian was found, and may be related to vegetable transportation. Considering the complexity of the P. xylostella population genetic structure from local and regional to global levels, we propose that developing ecologically sound strategies for managing this pest will require knowledge of the link between behavioral and population ecology and its genetic structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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