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Enregistrement W2185030063 · doi:10.3732/ajb.1100375

Phylogeny of <i>Opuntia</i> s.s. (Cactaceae): Clade delineation, geographic origins, and reticulate evolution

2012· article· en· W2185030063 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotanical Research and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCladeNdhFReticulate evolutionEvolutionary biologyParaphylyReticulatePhylogeneticsCharacter evolutionTaxonMolecular phylogeneticsBiogeographyZoologyEcologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: The opuntias (nopales, prickly pears) are not only culturally, ecologically, economically, and medicinally important, but are renowned for their taxonomic difficulty due to interspecific hybridization, polyploidy, and morphological variability. Evolutionary relationships in these stem succulents have been insufficiently studied; thus, delimitation of Opuntia s.s. and major subclades, as well as the biogeographic history of this enigmatic group, remain unresolved. METHODS: We sequenced the plastid intergenic spacers atpB-rbcL, ndhF-rpl32, psbJ-petA, and trnL-trnF, the plastid genes matK and ycf1, the nuclear gene ppc, and ITS to reconstruct the phylogeny of tribe Opuntieae, including Opuntia s.s. We used phylogenetic hypotheses to infer the biogeographic history, divergence times, and potential reticulate evolution of Opuntieae. KEY RESULTS: Within Opuntieae, a clade of Tacinga, Opuntia lilae, Brasiliopuntia, and O. schickendantzii is sister to a well-supported Opuntia s.s., which includes Nopalea. Opuntia s.s. originated in southwestern South America (SA) and then expanded to the Central Andean Valleys and the desert region of western North America (NA). Two major clades evolved in NA, which subsequently diversified into eight subclades. These expanded north to Canada and south to Central America and the Caribbean, eventually returning back to SA primarily via allopolyploid taxa. Dating approaches suggest that most of the major subclades in Opuntia s.s. originated during the Pliocene. CONCLUSIONS: Opuntia s.s. is a well-supported clade that includes Nopalea. The clade originated in southwestern SA, but the NA radiation was the most extensive, resulting in broad morphological diversity and frequent species formation through reticulate evolution and polyploidy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,865
Score d'incertitude au seuil0,142

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle