TET1 Modulates H4K16 Acetylation by Interacting with hMOF to Regulate Expression of DNA Repair Genes and Oncogenic Transformation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The Ten Eleven Translocation 1 (TET1) protein is a DNA demethylase that regulates gene expression through alteration of DNA methylation. Recent studies have demonstrated that TET1 could modulate transcriptional expression independent of its DNA demethylation activity; however, the detailed mechanisms underlying TET1’s role in such transcriptional regulation remain not well understood. Here, we uncovered that Tet1 formed a chromatin complex with histone acetyltransferase Mof and scaffold protein Sin3a in mouse embryonic stem cells by integrative genomic analysis using publicly available ChIP-seq data sets. Specifically, the TET1/SIN3A/hMOF complex mediates acetylation of histone H4 at lysine 16, via facilitating the binding of hMOF on chromatin, to regulate expression of important DNA repair genes in DNA double strand breaks, including TP53BP1 , RAD50 , RAD51 , and BRCA1 , for homologous recombination and non-homologous end joining repairs. Under hydrogen peroxide-induced DNA damage, dissociation of TET1 and hMOF from chromatin, concurrent with increased binding of SIRT1 on chromatin, led to hypo-acetylation of H4K16, reduced expression of these DNA repair genes, and DNA repair defects in a DNA methylation independent manner. A similar epigenetic dynamic alteration was also observed in H-RAS V12 oncogenic-transformed cells, supporting the notion that suppression of TET1 downregulates DNA repair genes through modifying H4K16ac, instead of its demethylation function, and therefore contribute to tumorigenesis. Taken together, our results suggested a mechanistic link between a novel TET1 complex and H4K16ac, DNA repair genes expression, and genomic instability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».