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Enregistrement W2186309588 · doi:10.1042/bj20150907

A ternary complex comprising FAK, PTPα and IP3 receptor 1 functionally engages focal adhesions and the endoplasmic reticulum to mediate IL-1-induced Ca2+ signalling in fibroblasts

2015· article· en· W2186309588 sur OpenAlexafffund
Qin Wang, Yongqiang Wang, Gregory P. Downey, Sergey V. Plotnikov, Christopher A. McCulloch

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndoplasmic reticulumSTIM1Focal adhesionReceptorCell biologyTernary complexBiophysicsChemistrySignal transductionBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ca(2+) release is tightly sequestered in eukaryotic cells to enable fine spatio-temporal control of signalling but how Ca(2+) release from the endoplasmic reticulum (ER) is linked to cell adhesions is not defined. We examined the spatial restriction of Ca(2+) release through the inositol 1,4,5-triphosphate receptor 1 (IP3R1) in response to interleukin-1 (IL-1) and the functions of the adhesion-associated proteins, focal adhesion kinase (FAK) and protein tyrosine phosphatase-α (PTPα). In cultured fibroblasts IL-1 treatment promoted co-localization of PTPα and FAK with the ER and increased association of IP3R1 with PTPα and FAK at focal adhesions (FAs). GST pull-down assays of purified proteins demonstrated that PTPα and FAK directly interacted with IP3R1. These interactions depended on the focal adhesion-targeting (FAT) and band4.1-ezrin-radixin-moesin (FERM) domains of FAK. PTPα was required for the association of IP3R1 with Src, which mediated IP3R1 phosphorylation and consequently ER Ca(2+) release. Collectively, these data indicate that PTPα and FAK, which are enriched in FAs, interact with IP3R1 at adjacent ER sites to spatially sequester IL-1-induced Ca(2+) signalling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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