Genome Editing in <i>Caenorhabditis briggsae</i> using the CRISPR/Cas9 System
Notice bibliographique
Résumé
Author Summary The CRISPR/Cas9 system has recently emerged as a powerful tool to engineer the genome of an organism. The system is adopted from bacteria where it confers immunity against invading foreign DNA. This work reports the first successful use of the CRISPR/Cas9 system in C. briggsae , a cousin of the well-known nematode C. elegans . We used two plasmids, one expressing Cas9 endonuclease and the other an engineered CRISPR RNA corresponding to the DNA sequence to be cleaved. Our approach allows for the generation of loss-of-function mutations in C. briggsae genes thereby facilitating a comparative study of gene function between nematodes. Abstract The CRISPR/Cas9 system is an efficient technique for generating targeted alterations in an organism’s genome. Here we describe a methodology for using the CRISPR/Cas9 system to generate mutations via non-homologous end joining in the nematode Caenorhabditis briggsae, a sister species of C. elegans . Evidence for somatic mutations and off-target mutations are also reported. The use of the CRISPR/Cas9 system in C. briggsae will greatly facilitate comparative studies to C. elegans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».