oF old doGs and new TriCks: The Epidemic of Hyper-virulent Clostridium difficile Infection
Notice bibliographique
Résumé
Clostridium difficile (CD) has been a well-recognized cause of antibiotic-associated diarrheal disease since the late 1970’s. A mutation in toxin gene regulation, however, has unleashed a new epidemic of hyper-virulent infection. This new strain of CD, designated B1/NAP1/027, has spread rapidly across North America, Europe, and Asia, and has now supplanted Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) as the leading cause of nosocomial infection in some U.S. hospitals. This paper highlights the changing epidemiologic and clinical features of this born-again pathogen, and discusses new approaches to the diagnosis, treatment, and prevention of modern era Clostridium difficile infection (CDI). SCOPE AND IMPACT OF CDI Toxin-producing strains of CD were first linked to cases of antibiotic-associated diarrhea in 1978. By the year 2000, CDI was known to cause 15-25% of cases of diarrhea associated with the use of antibiotics, particularly in hospital settings. In Quebec in 2003, an outbreak of severe diarrheal disease with high morbidity and mortality due to CD was described. 1 The incidence of CDI there quadrupled, and was associated with an unusually high attributable mortality of 6.9%, compared with a baseline of 1.5%. Outbreaks in the U.S. quickly followed. Subsequent analysis of microbial samples from Quebec as well as from six U.S. east coast states demonstrated the clonal nature of the outbreak strain, subsequently dubbed the North American Pulsed Field type 1 (NAP1) strain of CD. 2 Other designations for this same strain include restriction endonuclease strain B1, and PCR ribotype 027 (or simply B1/NAP1/027). Since 1996, the incidence of CDI in the U.S. has more than doubled, with an estimated 3 million cases each year. Thus CDI in now possibly the most common identified bacterial cause of acute diarrhea in the U.S. 3 The total estimated cost (in 2005 dollars) of care for patients with CDI exceeds $3.2 billion. 4 In a
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».