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Enregistrement W2187783289 · doi:10.1186/s12861-015-0097-2

Hsp90 and hepatobiliary transformation during sea lamprey metamorphosis

2015· article· en· W2187783289 sur OpenAlexaff
Yu‐Wen Chung‐Davidson, Chu‐Yin Yeh, Ugo Bussy, Ke Li, Peter J. Davidson, Kaben G. Nanlohy, C. Titus Brown, Steve Whyard, Weiming Li

Notice bibliographique

RevueBMC Developmental Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver physiology and pathology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesU.S. Geological SurveyNational Institute of General Medical SciencesU.S. Fish and Wildlife ServiceGreat Lakes Fishery CommissionNational Science Foundation
Mots-clésMetamorphosisBiologyLampreyHsp90Internal medicineEndocrinologyCell biologyGeneBiochemistryLarvaHeat shock proteinEcologyFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Biliary atresia (BA) is a human infant disease with inflammatory fibrous obstructions in the bile ducts and is the most common cause for pediatric liver transplantation. In contrast, the sea lamprey undergoes developmental BA with transient cholestasis and fibrosis during metamorphosis, but emerges as a fecund adult. Therefore, sea lamprey liver metamorphosis may serve as an etiological model for human BA and provide pivotal information for hepatobiliary transformation and possible therapeutics. RESULTS: We hypothesized that liver metamorphosis in sea lamprey is due to transcriptional reprogramming that dictates cellular remodeling during metamorphosis. We determined global gene expressions in liver at several metamorphic landmark stages by integrating mRNA-Seq and gene ontology analyses, and validated the results with real-time quantitative PCR, histological and immunohistochemical staining. These analyses revealed that gene expressions of protein folding chaperones, membrane transporters and extracellular matrices were altered and shifted during liver metamorphosis. HSP90, important in protein folding and invertebrate metamorphosis, was identified as a candidate key factor during liver metamorphosis in sea lamprey. Blocking HSP90 with geldanamycin facilitated liver metamorphosis and decreased the gene expressions of the rate limiting enzyme for cholesterol biosynthesis, HMGCoA reductase (hmgcr), and bile acid biosynthesis, cyp7a1. Injection of hsp90 siRNA for 4 days altered gene expressions of met, hmgcr, cyp27a1, and slc10a1. Bile acid concentrations were increased while bile duct and gall bladder degeneration was facilitated and synchronized after hsp90 siRNA injection. CONCLUSIONS: HSP90 appears to play crucial roles in hepatobiliary transformation during sea lamprey metamorphosis. Sea lamprey is a useful animal model to study postembryonic development and mechanisms for hsp90-induced hepatobiliary transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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