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Enregistrement W2188327786 · doi:10.4238/vol9-3gmr897

Case Report A novel COMP mutation in an Inuit patient with pseudoachondroplasia and severe short stature

2010· article· en· W2188327786 sur OpenAlexaffabout
Alison M. Elliott, Patricia Bocangel, Martin H. Reed, Cheryl R. Greenberg

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésShort statureExonMissense mutationOsteochondrodysplasiaGeneticsMutationCartilage oligomeric matrix proteinMedicineBiologyGeneInternal medicinePathologyOsteoarthritis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudoachondroplasia (PSACH) is an autosomal dominant skeletal dysplasia, generally identified clinically at two years of age due to decreased linear growth and a waddling gait. Radiographic features include small and irregular epiphyses, with metaphyseal changes of the long bones and characteristic vertebral changes. Mutations in the COMP gene cause PSACH and some cases of multiple epiphyseal dysplasia. Mutations generally cluster in the calmodulin-like repeat regions of the gene. Mutations in exon 13 (encoding the seventh calmodulin-like repeat) have been associated with severe short stature (-6 SD) in PSACH. We examined an Inuit boy with PSACH and severe short stature. Height essentially remained at -1 SD on the PSACH growth curve (-7.5 SD on a normal growth curve at 10.5 years). Analysis of COMP in our patient revealed a previously undescribed heterozygous A>T substitution in exon 8, at nucleotide 812. This change in the sequence resulted in replacement of a highly conserved and negatively charged aspartic acid with an uncharged, hydrophobic valine at amino acid position 271. Both unaffected parents were negative for this genetic change. This exon encodes the first calmodulin-like repeat, which has not been previously implicated in severe short stature. We propose that this novel missense substitution is responsible for the phenotype of this patient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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