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Enregistrement W2188659903 · doi:10.4141/cjps10022

Proteomics analysis of salt-induced leaf proteins in two rice germplasms with different salt sensitivity

2011· article· en· W2188659903 sur OpenAlexvenueno aff
Dong‐Gi Lee, Kee Woong Park, Jae Young An, Young Geol Sohn, Jung Ki Ha, Hak Yoon Kim, Dong Won Bae, Kyung Hee Lee, Nam Jun Kang, Byung‐Hyun Lee, Kyu Young Kang, Jeung Joo Lee

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirectorate for Education and Human ResourcesMinistry of Education and Human Resources DevelopmentKorea Research Institute of Bioscience and Biotechnology
Mots-clésOryza sativaProteomicsProteomeChemistryTandem mass spectrometryRuBisCOSalt (chemistry)Mass spectrometryBotanyBiochemistryBiologyChromatographyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lee, D.-G., Park, K. W., An, J. Y., Sohn, Y. G., Ha, J. K., Kim, H. Y., Bae, D. W., Lee, K. H., Kang, N. J., Lee, B.-H., Kang, K.-Y. and Lee, J. J. 2011. Proteomics analysis of salt-induced leaf proteins in two rice germplasms with different salt sensitivity. Can. J. Plant Sci. 91: 337–349. This study was conducted to investigate salt-stress-related physiological responses and proteomics changes in the leaves of two rice (Oryza sativa L.) cultivars. Shoot growth and water content of rice leaves were more severely reduced in Dalseongaengmi-44 than in Dongjin under salt stress. The salt-sensitive Dalseongaengmi-44 exhibited a greater increase in sodium ion accumulation in its leaves than the salt tolerant Dongjin. Comparative analysis of the rice leaf proteins using two-dimensional gel electrophoresis (2-DGE) revealed that a total of 23 proteins were up-regulated under salt stress. Based on matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry and/or electrospray ionization-tandem mass spectrometry analyses, the 23 protein spots were found to represent 16 different proteins. Ten of the identified proteins were previously reported to be salt-responsive proteins, while six, class III peroxidase 29 precursor, beta-1,3-glucanase precursor, OSJNBa0086A10.7 (putative transcription factor), putative chaperon 21 precursor, Rubisco activase small isoform precursor and drought-induced S-like ribonuclease, were novel salt-induced proteins. Under salt stress, fragmentation was increased in several proteins containing the Rubisco large chain. The results of these physiological and proteomics analyses provide useful information that can lead to a better understanding of the molecular basis of salt-stress responses in rice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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