A panel of microsatellite markers for genetic diversity and parentage analysis of dog breeds in Pakistan.
Notice bibliographique
Résumé
A molecular genetics tool comprised of a panel of 15 microsatellite markers was developed and used to investigate parentage and breed characterization of two most kept breeds of dogs including German shepherd and Labrador retriever in Pakistan. Blood samples of 20 dog families (10 from each breed) were collected from Army dog Breeding Training Center and School, Rawalpindi, Pakistan and Kennel Club of Pakistan. Genomic DNA was extracted by standard inorganic protocol. Microsatellite markers with high Polymorphism Information Content (PIC) and He (Hetrozygosity) values were selected and optimized into four multiplexes . Amplification reactions were followed by genotyping in 7% non-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). Parentage analysis of 20 families using this panel of microsatellite markers was 100% successful. Average values of Polymorphism Information Content (PIC), Heterozygosity (He) and Combined Power of Exclusion (CPE) combined for both of the breeds were found to be 0.724, 0.6345 and 0.9998 respectively. Moreover, deviation from Hardy-Weinberg equilibrium equation was observed moderately for both dog breeds. Allelic frequencies for majority of the microsatellite markers between both dog breeds were clearly distinct. This study demonstrated the panel of 15 microsatellite markers could effectively validate parentage and breed characterization in dogs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».