Minimal 16q Genomic Loss Implicates <i>Cadherin-11</i> in Retinoblastoma
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Retinoblastoma is initiated by loss of both RB1 alleles. Previous studies have shown that retinoblastoma tumors also show further genomic gains and losses. We now define a 2.62 Mbp minimal region of genomic loss of chromosome 16q22, which is likely to contain tumor suppressor gene(s), in 76 retinoblastoma tumors, using loss of heterozygosity (30 of 76 tumors) and quantitative multiplex PCR (71 of 76 tumors). The sequence-tagged site WI-5835 within intron 2 of the cadherin-11 (CDH11) gene showed the highest frequency of loss (54%, 22 of 41 samples tested). A second hotspot for loss (39%, 9 of 23 samples tested) was detected within intron 2 of the cadherin-13 (CDH13) gene. Furthermore, deletion of the exons of CDH11 and/or WI-5835 was shown by quantitative multiplex PCR in 17 of 30 (57%) of previously untested tumors. Immunoblot analyses revealed that 91% (20 of 22) retinoblastoma exhibited either a complete loss or a decrease of the intact form of CDH11 and 8 of 13 showed a prevalent band suggestive of the variant form. Copy number of WI-5835 for these samples correlated with CDH11 protein expression. CDH11 staining was evident in the inner nuclear layer in early mouse retinal development and in small transgenic murine SV40 large T antigen-induced retinoblastoma tumors, but advanced tumors frequently showed loss of CDH11 expression by reverse transcription-PCR, suggestive of a role for CDH11 in tumor progression or metastasis. CDH13 protein and mRNA were consistently expressed in all human and murine retinoblastoma compared with normal adult human retina. Our analyses implicate CDH11, but not CDH13, as a potential tumor suppressor gene in retinoblastoma.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle