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Enregistrement W2189782881

Global gene expression profiles of subcutaneous adipose tissue in obese and non-obese young men

2005· dissertation· en· W2189782881 sur OpenAlexfundno aff
Curtis R. French

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2005
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Disease and Adiposity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAdipose tissueGeneLipolysisGene expressionDNA microarrayBiologySubcutaneous adipose tissueGene expression profilingMicroarrayEndocrinologyBioinformaticsInternal medicineGeneticsMedicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: The current study was designed to compare global gene expression profiles of subcutaneous adipose tissue (SCAT) from obese and non-obese young men using whole human genome microarrays. -- Research methods and procedures: Sixteen healthy young men aged 20-27 participated in the study. Total RNA was isolated from SCAT, and competitively hybridized with a universal human reference RNA to Agilent's 44K whole human genome chip. A paired study design was used; ratios for each obese individual were directly compared to those of a matched non-obese individual. -- Results and Discussion: We identified 114 significantly up-regulated and 204 downregulated genes and transcripts in obese SCAT, 232 of which have defined names. For 181 of the genes with defined names, adipose tissue expression has not been reported previously. Gene Ontology (GO) analysis revealed an over-representation of genes involved in apoptosis, cell adhesion, cellular morphogenesis, and cell growth as up regulated in obese subjects. Genes with functions in the mitochondria, including genes involved in ATP coupled electron transport, were down regulated in obese subjects. Clustering analysis identified a sub-set of 27 genes that was able to accurately distinguish obese from non-obese subjects. Moreover, numerous genes that may influence the rate of lipolysis were also found to be differentially expressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,162
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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