Global gene expression profiles of subcutaneous adipose tissue in obese and non-obese young men
Notice bibliographique
Résumé
Objective: The current study was designed to compare global gene expression profiles of subcutaneous adipose tissue (SCAT) from obese and non-obese young men using whole human genome microarrays. -- Research methods and procedures: Sixteen healthy young men aged 20-27 participated in the study. Total RNA was isolated from SCAT, and competitively hybridized with a universal human reference RNA to Agilent's 44K whole human genome chip. A paired study design was used; ratios for each obese individual were directly compared to those of a matched non-obese individual. -- Results and Discussion: We identified 114 significantly up-regulated and 204 downregulated genes and transcripts in obese SCAT, 232 of which have defined names. For 181 of the genes with defined names, adipose tissue expression has not been reported previously. Gene Ontology (GO) analysis revealed an over-representation of genes involved in apoptosis, cell adhesion, cellular morphogenesis, and cell growth as up regulated in obese subjects. Genes with functions in the mitochondria, including genes involved in ATP coupled electron transport, were down regulated in obese subjects. Clustering analysis identified a sub-set of 27 genes that was able to accurately distinguish obese from non-obese subjects. Moreover, numerous genes that may influence the rate of lipolysis were also found to be differentially expressed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».