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Enregistrement W2190447163 · doi:10.1089/scd.2015.0169

Development and Validation of a Rex1-RFP Potency Activity Reporter Assay That Quantifies Stress-Forced Potency Loss in Mouse Embryonic Stem Cells

2015· article· en· W2190447163 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueStem Cells and Development · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthWayne State University
Mots-clésBiologyEmbryonic stem cellRex1Flow cytometryGreen fluorescent proteinStem cellPotencyMolecular biologyCell biologyAndrologyIn vitroBiochemistryInduced pluripotent stem cellMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Assays for embryonic stem cells (ESCs) of the blastocyst are needed to quantify stress-induced decreases of potent subpopulations. High-throughput screens (HTSs) of stressed ESCs quantify embryonic stress, diminishing laboratory animal needs. Normal or stress-induced ESC differentiation is marked by Rex1 potency factor loss. Potency reporter ESC assays were developed, using low-stress techniques to create transgenic ESCs. Rex1 and Oct4 promoters drove RFP and green fluorescent protein (GFP) expression, respectively. Lentivirus infection and fluorescence-activated cell sorting selection of ESCs obviated the need for stressful electroporation and antibiotic selection, respectively. We showed using immunoblots, microscopic analysis, flow cytometry, and fluorescence microplate reader that the response to stress of potency-reporter ESCs is similar to parental ESCs assayed by biochemical means. Stress caused a dose-dependent decrease in bright Rex1-RFP(+) ESCs and increase in Rex1 dim ESCs. At highest stress, ∼ 20% of bright Rex1-RFP cells are lost coinciding with a 2.8-fold increase in Rex1-RFP dim cells that approach 20%. This conversion of bright to dim cells tested by flow cytometry is commensurate with about 60% loss in fluorescence measured by microplate reader. Dose-dependent stress-induced Rex1-RFP and endogenous Rex1 protein decreases are similar. The data show that Rex1 reporter ESCs accurately report stress in a microplate reader-based HTS. The increasing dim Rex1 subpopulation size is balanced by the decreasing total ESC number during culture at multiple sorbitol doses. This is consistent with previous observations that stress forces potency decrease and differentiation increase to compensate for stress-induced diminished stem cell population growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle