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Enregistrement W2190474604 · doi:10.5539/jmbr.v5n1p56

Study on the Heterosis of the First Generation of Hybrid between Chinese and Korean Populations of Scapharca broughtonii using Methylation-Sensitive Amplification Polymorphism (MSAP)

2015· article· en· W2190474604 sur OpenAlexvenueno aff
Hailin Sun, Yanxin Zheng, Chunnuan Zhao, Tao Yu, Jianguo Lin

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylationDNA methylationHeterosisBiologyEpigeneticsGeneticsCytosineGenePolymorphism (computer science)Molecular biologyAlleleGene expressionBotanyHybrid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<p class="1Body">DNA methylation is known to play an important role in the regulation of gene expression in eukaryotes. In this study, the author assessed the extent and pattern of cytosine methylation in the <em>Scapharca broughtonii</em> genome using the technique of methylation-sensitive amplified polymorphism (MSAP).The results showed that, DNA methylation rate was negatively related to the shell length, the gross weight and the weight of soft body, but positively related to the shell broadness and the shell height; there was significantly different between the parents and the offspring: 31.6% of 5'-CCGG sites in the <em>Patinopecten yessoensis</em> of Korean populations genome were cytosine methylated, and in the <em>Patinopecten yessoensis</em> of Chinese populations were 33%, the methylation rates of F1 was 29.98%; four classes of patterns were identified in a comparative assay of cytosine methylation in the parents and hybrid, increased methylation was detected in the hybrid compared to the parents at some of the recognition sites, while decreased methylation in the hybrid was detected at other sites. It indicated that the alteration of methylation resulted from cross-breeding, and the inbreeding did not change the methylation ratio and patterns; The DNA cytosine methylation has a relationship with the heterosis.</p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,223
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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Résumé présentoui

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