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Enregistrement W2190865335 · doi:10.1016/j.celrep.2015.09.054

A Metabolic Signature of Mitochondrial Dysfunction Revealed through a Monogenic Form of Leigh Syndrome

2015· article· en· W2190865335 sur OpenAlexafffundabout
Julie Legault, Laura Strittmatter, Jessica Tardif, Rohit Sharma, Vanessa Tremblay-Vaillancourt, Chantale Aubut, Gabrielle Boucher, Clary B. Clish, Denis Cyr, Caroline Daneault, Paula J. Waters, Azadeh Aliskashani, Bruce G. Allen, Claudine Beauchamp, Chantal Bémeur, Yan Burelle, Guy Charron, Lise Coderre, Christine Des Rosiers, Sonia Deschênes, F. Labarthe, Jeannine Landry, Catherine Laprise, Geneviève Lavallée, Pierre Lavoie, Bruno Maranda, Yvette Mukaneza, Tamiko Nishimura, John D. Rioux, Marie-Ève Rivard, Florin Sasarman, Eric A. Shoubridge, Nancy Tremblay, Luc Vachon, Josée Villeneuve, Vamsi K. Mootha

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensCentre de Santé et de Services Sociaux de ChicoutimiUniversité du Québec à ChicoutimiCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of General Medical SciencesU.S. Public Health ServiceHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyMitochondrial diseaseMitochondrionRespiratory chainMitochondrial respiratory chainAdiponectinMitochondrial DNAInternal medicineEndocrinologyGeneticsDiabetes mellitusMedicineInsulin resistanceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A decline in mitochondrial respiration represents the root cause of a large number of inborn errors of metabolism. It is also associated with common age-associated diseases and the aging process. To gain insight into the systemic, biochemical consequences of respiratory chain dysfunction, we performed a case-control, prospective metabolic profiling study in a genetically homogenous cohort of patients with Leigh syndrome French Canadian variant, a mitochondrial respiratory chain disease due to loss-of-function mutations in LRPPRC. We discovered 45 plasma and urinary analytes discriminating patients from controls, including classic markers of mitochondrial metabolic dysfunction (lactate and acylcarnitines), as well as unexpected markers of cardiometabolic risk (insulin and adiponectin), amino acid catabolism linked to NADH status (α-hydroxybutyrate), and NAD(+) biosynthesis (kynurenine and 3-hydroxyanthranilic acid). Our study identifies systemic, metabolic pathway derangements that can lie downstream of primary mitochondrial lesions, with implications for understanding how the organelle contributes to rare and common diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations151
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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