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Enregistrement W2191078196 · doi:10.1155/2014/698352

Predicting<i>C282Y</i>Homozygote Genotype for Hemochromatosis Using Serum Ferritin and Transferrin Saturation Values from 44,809 Participants of the HEIRS Study

2014· article· en· W2191078196 sur OpenAlexaff
Andrew Lim, Mark Speechley, Paul C. Adams

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Gastroenterology and Hepatology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransferrin saturationHemochromatosisFerritinTransferrinLogistic regressionMedicineReceiver operating characteristicGenotypeSerum ironSerum ferritinInternal medicineGenotypingGastroenterologyGeneticsBiologyGeneAnemia

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The simultaneous interpretation of serum ferritin level and transferrin saturation has been used as a clinical guide to diagnose genetic hemochromatosis. The Hemochromatosis and Iron Overload Screening (HEIRS) Study screened 101,168 North American participants for serum ferritin level and transferrin saturation, and C282Y genotyping for the HFE gene. METHODS: Logistic regression involving a subsample of Caucasians (n=44,809) was used to predict individual probabilities of HFE C282Y homozygosity using serum ferritin and transferrin saturation values. Men (n=17,323) and women (n=27,486) were analyzed separately. Regression equations were evaluated using area under the curve from ROC analysis and variance explained by Nagelkerke's pseudo R-squared. An Android smartphone App and website application were developed to provide physicians with easy access to predicting C282Y homozygosity of the HFE gene. RESULTS: The logistic equation had an area under the ROC curve of 0.91 for men and 0.89 for women. The pseudo R-squared was 0.44 for men and 0.34 for women. An example analysis was a Caucasian man with a transferrin saturation of 50% and a ferritin level of 500 µg⁄L, who had a 1.3% (95% CI 1.1% to 8.8%) probability of being a C282Y homozygote. CONCLUSIONS: A large primary care-based sample of 44,809 participants contributed to the development of a new computer⁄smartphone tool that predicts the probability of being a C282Y homozygote of the HFE gene from serum ferritin and transferrin saturation values.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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