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Enregistrement W2192117880 · doi:10.1167/iovs.15-17802

High Throughput Assay Identifies Glafenine as a Corrector for the Folding Defect in Corneal Dystrophy–Causing Mutants of SLC4A11

2015· article· en· W2192117880 sur OpenAlexaff
Anthony M. Chiu, Jake Mandziuk, Sampath K. Loganathan, Kumari Alka, Joseph R. Casey

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantCorneal dystrophyFolding (DSP implementation)ChemistryComputational biologyBiologyMedicineOphthalmologyGeneticsCorneaGeneEngineeringStructural engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Protein misfolding, causing retention of nascent protein in the endoplasmic reticulum (ER), is the most common molecular phenotype for disease alleles of membrane proteins. Strategies are needed to identify therapeutics able to correct such folding/trafficking defects. Mutations of SLC4A11, a plasma membrane transport protein of the human corneal endothelial cell layer, cause cases of congenital hereditary endothelial dystrophy, Harboyan syndrome, and Fuchs' endothelial corneal dystrophy. Most SLC4A11 mutations induce SLC4A11 misfolding and retention in the ER. METHODS: An assay amenable to high-throughput screening was developed to quantify SLC4A11 at the plasma membrane, enabling a search for potential traffic-correcting small molecules. The assay was validated by comparing cell surface abundance of SLC4A11 mutants measured in the assay to observations from confocal immunofluorescence and values from cell surface biotinylation. Functionality of mutant proteins was assessed, using a confocal microscopic green fluorescent protein (GFP) water flux assay where relative rates of cell swelling are compared. RESULTS: A small-scale screen revealed that the nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs), glafenine, ibuprofen, and acetylsalicylic acid dissolved in 0.2% dimethyl sulfoxide (DMSO), partially rescued the trafficking defect in some SLC4A11 mutants, expressed in HEK293 cells. These SLC4A11 mutants retained functional activity when rescued to the plasma membrane by glafenine treatment. Glafenine was effective with an EC50 of 1.5 ± 0.7 μM. CONCLUSIONS: These data suggest that glafenine, and perhaps other NSAIDs, hold potential as therapeutics for misfolded membrane proteins, like SLC4A11. The high throughput approach described here can be modified to identify correctors of other misfolded plasma membrane proteins that cause eye disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,918

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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