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Enregistrement W2192984162 · doi:10.3389/fneur.2015.00228

The Virtual Brain: Modeling Biological Correlates of Recovery after Chronic Stroke

2015· article· en· W2192984162 sur OpenAlexaff
Maria Inez Falcon, Jeffrey D. Riley, Viktor Jirsa, Anthony R. McIntosh, A. Duke Shereen, E. Elinor Chen, Ana Solodkin

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neurology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeJames S. McDonnell Foundation
Mots-clésBetweenness centralityCentralityStroke (engine)Computer scienceNetwork controllabilityNeuroimagingCoupling (piping)Stroke recoveryGraphPower graph analysisPsychologyArtificial intelligenceNeuroscienceTheoretical computer scienceMathematicsStatisticsRehabilitationPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There currently remains considerable variability in stroke survivor recovery. To address this, developing individualized treatment has become an important goal in stroke treatment. As a first step, it is necessary to determine brain dynamics associated with stroke and recovery. While recent methods have made strides in this direction, we still lack physiological biomarkers. The Virtual Brain (TVB) is a novel application for modeling brain dynamics that simulates an individual's brain activity by integrating their own neuroimaging data with local biophysical models. Here, we give a detailed description of the TVB modeling process and explore model parameters associated with stroke. In order to establish a parallel between this new type of modeling and those currently in use, in this work we establish an association between a specific TVB parameter (long-range coupling) that increases after stroke with metrics derived from graph analysis. We used TVB to simulate the individual BOLD signals for 20 patients with stroke and 10 healthy controls. We performed graph analysis on their structural connectivity matrices calculating degree centrality, betweenness centrality, and global efficiency. Linear regression analysis demonstrated that long-range coupling is negatively correlated with global efficiency (P = 0.038), but is not correlated with degree centrality or betweenness centrality. Our results suggest that the larger influence of local dynamics seen through the long-range coupling parameter is closely associated with a decreased efficiency of the system. We thus propose that the increase in the long-range parameter in TVB (indicating a bias toward local over global dynamics) is deleterious because it reduces communication as suggested by the decrease in efficiency. The new model platform TVB hence provides a novel perspective to understanding biophysical parameters responsible for global brain dynamics after stroke, allowing the design of focused therapeutic interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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