Diazotrophic bacteria reside inside <i>Suillus tomentosus</i> / <i>Pinus contorta</i> tuberculate ectomycorrhizae
Notice bibliographique
Résumé
Culturable bacteria from Suillus tomentosus / Pinus contorta tuberculate ectomycorrhizae (TEM) tissues were evaluated to identify possible causative agents of TEM-associated nitrogenase activity in a naturally regenerating pine forest. Bacteria from internal and external TEM tissues were isolated over a 3 year sampling period and representative colony types were identified using gas chromatograph fatty acid methyl ester and 16S rDNA sequence analyses. Eighteen species of bacteria belonging to at least eight genera (Pseudomonas, Bacillus, Xanthomonas, Xanthobacter, Sphingobacterium, Burkholderia, Curtobacterium, and an actinomycete) were isolated from the TEM surface. In contrast, four bacterial species belonging to three genera (Paenibacillus, Methylobacterium, and Micrococcus) distinct from those found on the TEM surface were isolated from surface-sterilized TEM. None of the TEM surface isolates were diazotrophic but three of the four species from the TEM interior (Paenibacillus amylolyticus, Paenibacillus pabuli, and Methylobacterium mesophilicum) possessed the nifH gene and were capable of some acetylene reduction. Our findings indicate that nitrogen fixing bacteria also reside within TEM and should be considered as possible causative agents of TEM-associated nitrogenase activity on lodgepole pine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».