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Enregistrement W2195839407 · doi:10.1371/journal.pone.0137947

Functional Divergence of Hsp90 Genetic Interactions in Biofilm and Planktonic Cellular States

2015· article· en· W2195839407 sur OpenAlexafffund
Stephanie Diezmann, Michelle D. Leach, Leah E. Cowen

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of BathNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWellcome Trust
Mots-clésBiofilmFilamentationCandida albicansBiologyHsp90Transcription factorCell biologyCorpus albicansMicrobiologyGeneticsGeneHeat shock proteinBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Candida albicans is among the most prevalent opportunistic fungal pathogens. Its capacity to cause life-threatening bloodstream infections is associated with the ability to form biofilms, which are intrinsically drug resistant reservoirs for dispersal. A key regulator of biofilm drug resistance and dispersal is the molecular chaperone Hsp90, which stabilizes many signal transducers. We previously identified 226 C. albicans Hsp90 genetic interactors under planktonic conditions, of which 56 are involved in transcriptional regulation. Six of these transcriptional regulators have previously been implicated in biofilm formation, suggesting that Hsp90 genetic interactions identified in planktonic conditions may have functional significance in biofilms. Here, we explored the relationship between Hsp90 and five of these transcription factor genetic interactors: BCR1, MIG1, TEC1, TUP1, and UPC2. We deleted each transcription factor gene in an Hsp90 conditional expression strain, and assessed biofilm formation and morphogenesis. Strikingly, depletion of Hsp90 conferred no additional biofilm defect in the mutants. An interaction was observed in which deletion of BCR1 enhanced filamentation upon reduction of Hsp90 levels. Further, although Hsp90 modulates expression of TEC1, TUP1, and UPC2 in planktonic conditions, it has no impact in biofilms. Lastly, we probed for physical interactions between Hsp90 and Tup1, whose WD40 domain suggests that it might interact with Hsp90 directly. Hsp90 and Tup1 formed a stable complex, independent of temperature or developmental state. Our results illuminate a physical interaction between Hsp90 and a key transcriptional regulator of filamentation and biofilm formation, and suggest that Hsp90 has distinct genetic interactions in planktonic and biofilm cellular states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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