Sharing of chloroplast haplotypes among red oak species suggests interspecific gene flow between neighboring populations
Notice bibliographique
Résumé
The North American red oak species Quercus rubra L., Quercus ellipsoidalis E. J. Hill, Quercus velutina Lam., and Quercus coccinea Münchh. are morphologically similar and showed very low interspecific differentiation at most nuclear genetic markers in our earlier analyses (<10%). However, a few genetic markers showed interspecific differentiation values (up to 84%) above neutral expectations, a pattern of genomic divergence consistent with models of ecological speciation in the face of gene flow and strong divergent selection. Accordingly, these interfertile species are predicted to maintain differential adaptations to drought, while neutral regions of the genome appear to be homogenized by interspecific gene flow. According to this model of maintenance of species integrity by divergent selection with gene flow, we expect a sharing of chloroplast haplotypes between interspecific population pairs. We analyzed maternally inherited chloroplast DNA markers for the first time in interspecific populations of the red oaks (section Lobatae) to provide additional evidence for contemporary gene flow between Q. rubra and Q. ellipsoidalis and between Q. velutina and Q. ellipsoidalis. Very low interspecific differentiation (GST = 0.023), but pronounced genetic differentiation among populations from different regions (GST = 0.277) across species, and sharing of regional chloroplast haplotypes between species in sympatric and neighboring populations provided strong evidence for contemporary interspecific gene flow. The pattern of divergence at chloroplast DNA markers in red oaks suggests interspecific gene flow that resulted in a sharing of chloroplast types while the ecological and morphological distinctness of species was maintained.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».