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Enregistrement W2196410047 · doi:10.1038/ejhg.2015.211

A de novo microdeletion of SEMA5A in a boy with autism spectrum disorder and intellectual disability

2015· article· en· W2196410047 sur OpenAlexfundno aff
Anne‐Laure Mosca‐Boidron, Lucie Gueneau, Guillaume Huguet, Alice Goldenberg, Céline Henry, Nadège Gigot, Emilie Pallesi‐Pocachard, Antonio Falace, Laurence Duplomb, Julien Thévenon, Yannis Duffourd, Judith St‐Onge, Pascal Chambon, Jean‐Baptiste Rivière, Christel Thauvin‐Robinet, Patrick Callier, Nathalie Marle, Muriel Payet, Clémence Ragon, Hany Goubran Botros, Julien Buratti, Sophie Caldérari, Guillaume Dumas, Richard Delorme, Nathalie Lagarde, Jean‐Michel Pinoit, Antoine Rosier, Alice Masurel‐Paulet, Carlos Cardoso, Francine Mugneret, Pascale Saugier-Véber, Dominique Campion, Laurence Faivre, Thomas Bourgeron

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Human Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConny-Maeva Charitable FoundationFondation OrangeCentre National de la Recherche ScientifiqueConseil régional de Bourgogne-Franche-ComtéUniversité Paris DiderotAgence Nationale de la RechercheInstitut national de la recherche scientifique
Mots-clésSemaphorinBiologyGeneticsIntellectual disabilitySanger sequencingAutismAutism spectrum disorderMicrodeletion syndromeChromosomal translocationGeneChromosomeMutationMedicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Semaphorins are a large family of secreted and membrane-associated proteins necessary for wiring of the brain. Semaphorin 5A (SEMA5A) acts as a bifunctional guidance cue, exerting both attractive and inhibitory effects on developing axons. Previous studies have suggested that SEMA5A could be a susceptibility gene for autism spectrum disorders (ASDs). We first identified a de novo translocation t(5;22)(p15.3;q11.21) in a patient with ASD and intellectual disability (ID). At the translocation breakpoint on chromosome 5, we observed a 861-kb deletion encompassing the end of the SEMA5A gene. We delineated the breakpoint by NGS and observed that no gene was disrupted on chromosome 22. We then used Sanger sequencing to search for deleterious variants affecting SEMA5A in 142 patients with ASD. We also identified two independent heterozygous variants located in a conserved functional domain of the protein. Both variants were maternally inherited and predicted as deleterious. Our genetic screens identified the first case of a de novo SEMA5A microdeletion in a patient with ASD and ID. Although our study alone cannot formally associate SEMA5A with susceptibility to ASD, it provides additional evidence that Semaphorin dysfunction could lead to ASD and ID. Further studies on Semaphorins are warranted to better understand the role of this family of genes in susceptibility to neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,244
Score d'incertitude au seuil0,358

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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