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Enregistrement W2197378730 · doi:10.4141/cjas-2014-186

The relationship between the polymorphism of the porcine <i>CAST</i> gene and productive traits in pigs

2015· article· en· W2197378730 sur OpenAlexvenueno aff
Paweł Urbański, Mariusz Pierzchała, A. Terman, M. Kamyczek, M. Różycki, Agnieszka Roszczyk, Urszula Czarnik

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMeat and Animal Product Quality
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeSireBiologyBreedCalpastatinLocus (genetics)GeneticsPolymorphism (computer science)Gene polymorphismAnimal scienceVeterinary medicineGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Urbański, P., Pierzchała, M., Terman, A., Kamyczek, M., Różycki, M., Roszczyk, A. and Czarnik, U. 2015. The relationship between the polymorphism of the porcine CAST gene and productive traits in pigs. Can. J. Anim. Sci. 95: 361–367. The aim of the study was to characterize the polymorphism of the calpastatin gene identified with ApaLI, Hpy188I and PvuII restriction enzymes in two pig breeds and one line bred in Poland, and to evaluate the relationship between the CAST genotype and carcass traits. The analysis covered a total of 617 pigs of two breeds, Polish Landrace (185) and Polish Large White (216), and synthetic line L990 (216). All animals studied appeared to be monomorphic at two loci: CAST/ApaLI and CAST/Hpy188I, while three genotypes were observed at CAST/PvuII locus. Statistical analysis was carried out for each breed separately using the least square methods of the GLM procedure. The model included the effect of the CAST genotype, fixed effect of the RYR1 genotype and the effect of the sire. Because the RYR1 genotype could significantly modify the effect of other genes, the effect of the RYR1 genotype was included in the statistical model. The relationship between the polymorphism and several productive traits was identified in each of the study groups of pigs. Animals carrying the heterozygous genotype at this locus showed most extreme values for some of the traits tested. Our results suggest that the CAST /PvuII genotype might be utilized in the selection of valuable pig carcass traits, particularly weight and size of the loin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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