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Enregistrement W2199245638 · doi:10.1534/genetics.115.180265

The Mediator Kinase Module Restrains Epidermal Growth Factor Receptor Signaling and Represses Vulval Cell Fate Specification in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2015· article· en· W2199245638 sur OpenAlexafffund
Jennifer M. Grants, Lisa Ying, Akinori Yoda, Charlotte C You, Hideyuki Okano, Hitoshi Sawa, Stefan Taubert

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOffice of Research Infrastructure Programs, National Institutes of HealthNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San FranciscoNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyCaenorhabditis elegansMediatorCell biologyGeneticsSignal transductionEpidermal growth factorReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell signaling pathways that control proliferation and determine cell fates are tightly regulated to prevent developmental anomalies and cancer. Transcription factors and coregulators are important effectors of signaling pathway output, as they regulate downstream gene programs. In Caenorhabditis elegans, several subunits of the Mediator transcriptional coregulator complex promote or inhibit vulva development, but pertinent mechanisms are poorly defined. Here, we show that Mediator's dissociable cyclin dependent kinase 8 (CDK8) module (CKM), consisting of cdk-8, cic-1/Cyclin C, mdt-12/dpy-22, and mdt-13/let-19, is required to inhibit ectopic vulval cell fates downstream of the epidermal growth factor receptor (EGFR)-Ras-extracellular signal-regulated kinase (ERK) pathway. cdk-8 inhibits ectopic vulva formation by acting downstream of mpk-1/ERK, cell autonomously in vulval cells, and in a kinase-dependent manner. We also provide evidence that the CKM acts as a corepressor for the Ets-family transcription factor LIN-1, as cdk-8 promotes transcriptional repression by LIN-1. In addition, we find that CKM mutation alters Mediator subunit requirements in vulva development: the mdt-23/sur-2 subunit, which is required for vulva development in wild-type worms, is dispensable for ectopic vulva formation in CKM mutants, which instead display hallmarks of unrestrained Mediator tail module activity. We propose a model whereby the CKM controls EGFR-Ras-ERK transcriptional output by corepressing LIN-1 and by fine tuning Mediator specificity, thus balancing transcriptional repression vs. activation in a critical developmental signaling pathway. Collectively, these data offer an explanation for CKM repression of EGFR signaling output and ectopic vulva formation and provide the first evidence of Mediator CKM-tail module subunit crosstalk in animals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,874

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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