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Enregistrement W2200470956

Molecular analysis of Candidate genes at the 22q region in Schizophrenia subjects

2012· article· en· W2200470956 sur OpenAlexaff
Kiran Kumar Halagur Bhoge Gowda, Jay Rao, Richard O’Reilly, Shiva M. Singh

Notice bibliographique

RevueResearch in Biotechnology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensWestern UniversityLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiGeorge syndromeSchizophrenia (object-oriented programming)Copy-number variationGeneticsGeneCandidate geneBiologyPhenotypeChromosomeAlleleMedicinePsychiatryGenome
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

22q11.2 deletion syndrome (22q11.2DS), also known as Velo-Cardio-Facial Syndrome (VCFS) or DiGeorge Syndrome, is a genetic disorder due to a micro deletion on chromosome 22q11.2. VCFS is associated with abnormalities in brain structure and with an increased risk of psychiatric disorders, particularly schizophrenia (SCZ). DNA copy  number is a largely unexplored source of human genetic variation that may contribute risk for complex disease like SCZ. The aim of this study was to assess Copy number variations (CNV) at candidate genes located in 22q11 region in SCZ subjects. We report aberrations in copy number  at PRODH and COMT gene loci supporting the hypothesis that dosage effects of 22q genes could lead to disruptions in neurotransmitter signaling and related neurobehavioral symptoms observed in SCZ subjects. The results support the hypothesis that the complex phenotype of 22qDS results either from the overlapping regulation of several genes within this region or from its concerted participation in a highly regulated process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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