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Enregistrement W2201678162 · doi:10.7554/elife.10365

Unravelling druggable signalling networks that control F508del-CFTR proteostasis

2015· article· en· W2201678162 sur OpenAlexafffund
Ramanath Narayana Hegde, Seetharaman Parashuraman, Francesco Iorio, Fabiana Ciciriello, Fabrizio Capuani, Annamaria Carissimo, Diego Carrella, Vincenzo Belcastro, Advait Subramanian, Laura Bounti, Maria Persico, Graeme W. Carlile, Luis J. V. Galietta, David Y. Thomas, Diego di Bernardo, Alberto Luini

Notice bibliographique

RevueeLife · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesSapienza Università di RomaCanadian Institutes of Health ResearchFondazione per la Ricerca sulla Fibrosi CisticaMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMinistero della SaluteAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroFondazione TelethonInstitute of GeneticsCanada Foundation for InnovationCystic Fibrosis Canada
Mots-clésProteostasisDruggabilityBiologyComputational biologySignallingCell biologyBioinformaticsChemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF) is caused by mutations in CF transmembrane conductance regulator (CFTR). The most frequent mutation (F508del-CFTR) results in altered proteostasis, that is, in the misfolding and intracellular degradation of the protein. The F508del-CFTR proteostasis machinery and its homeostatic regulation are well studied, while the question whether 'classical' signalling pathways and phosphorylation cascades might control proteostasis remains barely explored. Here, we have unravelled signalling cascades acting selectively on the F508del-CFTR folding-trafficking defects by analysing the mechanisms of action of F508del-CFTR proteostasis regulator drugs through an approach based on transcriptional profiling followed by deconvolution of their gene signatures. Targeting multiple components of these signalling pathways resulted in potent and specific correction of F508del-CFTR proteostasis and in synergy with pharmacochaperones. These results provide new insights into the physiology of cellular proteostasis and a rational basis for developing effective pharmacological correctors of the F508del-CFTR defect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,803
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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