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Enregistrement W2202148684 · doi:10.1186/s12931-015-0299-y

Asthma characteristics and biomarkers from the Airways Disease Endotyping for Personalized Therapeutics (ADEPT) longitudinal profiling study

2015· article· en· W2202148684 sur OpenAlexaff
Philip E. Silkoff, Irina Strâmbu, Michel Laviolette, Dave Singh, J. Mark FitzGerald, Sean Shao Wei Lam, Steven G. Kelsen, A. Eich, Andrea Ludwig-Sengpiel, G. C hupp, Vibeke Backer, Celeste Porsbjerg, Pierre‐Olivier Girodet, Patrick Berger, Richard Leigh, Joel N. Kline, Mark T. Dransfield, William J. Calhoun, Azra Hussaini, Sumita Khatri, Pascal Chanez, Vedrana S. Susulic, Elliot S. Barnathan, Máire Curran, Anuk Das, Carrie Brodmerkel, Frédéric Baribaud, Matthew J. Loza

Notice bibliographique

RevueRespiratory Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of CalgaryStornoway Diamond (Canada)Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProfiling (computer programming)AsthmaMedicineAdeptCOPDPersonalized medicineBiomarkerPulmonary diseaseDiseaseEndotypeBioinformaticsIntensive care medicineImmunologyInternal medicineBiologyComputer sciencePharmacologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Asthma is a heterogeneous disease and development of novel therapeutics requires an understanding of pathophysiologic phenotypes. The purpose of the ADEPT study was to correlate clinical features and biomarkers with molecular characteristics, by profiling asthma (NCT01274507). This report presents for the first time the study design, and characteristics of the recruited subjects. METHODS: Patients with a range of asthma severity and healthy non-atopic controls were enrolled. The asthmatic subjects were followed for 12 months. Assessments included history, patient questionnaires, spirometry, airway hyper-responsiveness to methacholine, fractional exhaled nitric oxide (FENO), and biomarkers measured in induced sputum, blood, and bronchoscopy samples. All subjects underwent sputum induction and 30 subjects/cohort had bronchoscopy. RESULTS: Mild (n = 52), moderate (n = 55), severe (n = 51) asthma cohorts and 30 healthy controls were enrolled from North America and Western Europe. Airflow obstruction, bronchodilator response and airways hyperresponsiveness increased with asthma severity, and severe asthma subjects had reduced forced vital capacity. Asthma control questionnaire-7 (ACQ7) scores worsened with asthma severity. In the asthmatics, mean values for all clinical and biomarker characteristics were stable over 12 months although individual variability was evident. FENO and blood eosinophils did not differ by asthma severity. Induced sputum eosinophils but not neutrophils were lower in mild compared to the moderate and severe asthma cohorts. CONCLUSIONS: The ADEPT study successfully enrolled asthmatics across a spectrum of severity and non-atopic controls. Clinical characteristics were related to asthma severity and in general asthma characteristics e.g. lung function, were stable over 12 months. Use of the ADEPT data should prove useful in defining biological phenotypes to facilitate personalized therapeutic approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,207
Score d'incertitude au seuil0,724

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,254
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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