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Enregistrement W2202899490 · doi:10.1038/nature16142

RETRACTED ARTICLE: A mechanism for the suppression of homologous recombination in G1 cells

2015· article· en· W2202899490 sur OpenAlexafffund
Alexandre Orthwein, Sylvie M. Noordermeer, Marcus D. Wilson, Sébastien Landry, Radoslav I. Enchev, Alana Sherker, Meagan Munro, Jordan Pinder, Jayme Salsman, Graham Dellaire, Bing Xia, Matthias Peter, Daniel Durocher

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifConcerns/Issues about Data;Concerns/Issues about Image;Upgrade/Update of Prior Notice(s);
Date1/27/2025 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueNature · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésHomologous recombinationRAD51Non-homologous end joiningDNA repairHomology directed repairCell biologyBiologyHomologous chromosomeGeneticsPALB2DNAMolecular biologyChemistryGeneMutationDNA mismatch repairGermline mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A mechanism for the repression of homologous recombination in G1, the stage of the cell cycle preceding replication, is determined; the critical aspects are the interaction between BRCA1 and PALB2–BRCA2, and suppression of DNA-end resection. Homologous recombination occurs primarily between sister chromatids, and therefore in the S and G2 phases of the cell cycle, after DNA has been replicated. Daniel Durocher and colleagues have determined how homologous recombination is repressed in G1, the stage of the cell cycle preceding replication. They find that the critical aspects are the interaction between BRCA1 and PALB2–BRCA2, and suppression of DNA-end resection. By restoring these activities, they demonstrate that homologous recombination can occur in G1, which could be useful as an approach for gene targeting in non-dividing cells. DNA repair by homologous recombination1 is highly suppressed in G1 cells2,3 to ensure that mitotic recombination occurs solely between sister chromatids4. Although many homologous recombination factors are cell-cycle regulated, the identity of the events that are both necessary and sufficient to suppress recombination in G1 cells is unknown. Here we report that the cell cycle controls the interaction of BRCA1 with PALB2–BRCA2 to constrain BRCA2 function to the S/G2 phases in human cells. We found that the BRCA1-interaction site on PALB2 is targeted by an E3 ubiquitin ligase composed of KEAP1, a PALB2-interacting protein5, in complex with cullin-3 (CUL3)–RBX1 (ref. 6). PALB2 ubiquitylation suppresses its interaction with BRCA1 and is counteracted by the deubiquitylase USP11, which is itself under cell cycle control. Restoration of the BRCA1–PALB2 interaction combined with the activation of DNA-end resection is sufficient to induce homologous recombination in G1, as measured by RAD51 recruitment, unscheduled DNA synthesis and a CRISPR–Cas9-based gene-targeting assay. We conclude that the mechanism prohibiting homologous recombination in G1 minimally consists of the suppression of DNA-end resection coupled with a multi-step block of the recruitment of BRCA2 to DNA damage sites that involves the inhibition of BRCA1–PALB2–BRCA2 complex assembly. We speculate that the ability to induce homologous recombination in G1 cells with defined factors could spur the development of gene-targeting applications in non-dividing cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0090,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,011

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations476
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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