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Enregistrement W2203589375 · doi:10.1128/9781555817732.ch23

Antibiotic Resistance Plasmids

2014· book-chapter· en· W2203589375 sur OpenAlexaff
Diane E. Taylor, Amera Gibreel, Trevor D. Lawley, Dobryan M. Tracz

Notice bibliographique

RevueASM Press eBooks · 2014
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmidAntibiotic resistanceBiologyMicrobiologyAntibioticsSpectinomycinGeneticsGene cassetteGeneIntegron

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This chapter provides an overview of plasmid classification systems and then describes the various mechanisms of plasmid-mediated resistance to antibacterial agents. The major pathways for the evolution of bacterial resistance plasmids are discussed. In general, plasmid-mediated resistance to antibacterials is a result of three major mechanisms: (i) destruction or modification of the antibacterial agents, (ii) prevention of the antibacterial agent from reaching its target in the bacterial cell, and (iii) production of an altered bacterial target. Resistance to tetracyclines, macrolides, glycopeptides, and quinolones are examples of this type of resistance. The majority of the approximately 60 known gene cassettes code for antibiotic resistance determinants. Genes in integrons have been found to encode resistance to a wide variety of antibiotics, including aminoglycosides, chloramphenicol, erythromycin, and the β-lactams. The aadA1 gene cassette (encoding spectinomycin resistance), carried by Tn21, is one of the most widespread resistance genes. Although the epidemiology of integrons has only recently been investigated, several reports have emphasized the importance of integrons in the dissemination of antibiotic resistance. IncHI1 plasmids are representative of antibiotic resistance plasmids that play a central role in the emergence and reemergence of bacterial pathogens. The chapter highlights the dynamic processes involved in plasmid evolution to acquire resistance markers. Transposons, integrons, conjugation, and other mechanisms of resistance spread are all employed by pathogens to respond to continued antibiotic usage in the clinic and in the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,083

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0250,026

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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