Early-late genes of the ecdysone cascade as models for transcriptional studies
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Notice bibliographique
Résumé
The DHR3 and Hr4 early-late genes of the ecdysone cascade are described as models for transcriptional studies in Drosophila cells. In a set of experiments, it became clear that these genes are a convenient and versatile system for research into the physiological conditions upon 20-hydroxyecdysone induction. DHR3 and Hr4 gene transcription is characterized by fast activation kinetics, which enables transcriptional studies without the influence of indirect effects. A limited number of activated genes (only 73 genes are induced one hour after treatment) promote the selectivity of transcriptional studies via 20-hydroxyecdysone induction. DHR3 and Hr4 gene expression is dose dependent, is completely controlled by the hormone titer and decreases within hours of 20-hydroxyecdysone withdrawal. The DHR3 and Hr4 gene promoters become functional within 20 minutes after induction, which makes them useful tools for investigation if the early activation process. Their transcription is controlled by the RNA polymerase II pausing mechanism, which is widespread in the genome of Drosophila melanogaster but is still underinvestigated. Uniform expression activation of the DHR3 and Hr4 genes in a cell population was confirmed at both the RNA and protein levels. Homogeneity of the transcription response makes DHR3/Hr4 system valuable for investigation of the protein dynamics during transcription induction.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle