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Enregistrement W2207268770

Probing the membrane topology of a diacylglycerol acytransferase type I from Brassica Napus

2005· dissertation· en· W2207268770 sur OpenAlexfundaboutno aff
Nora A. Foroud

Notice bibliographique

RevueOpen ULeth Scholarship (OPUS) (University of Lethbridge) · 2005
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Lethbridge
Mots-clésBrassicaDiacylglycerol kinaseTopology (electrical circuits)Type (biology)BotanyBiologyCell biologyEngineeringElectrical engineeringEcology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diacylglycerol acyltransferase (DGAT), an integral membrane protein of the endoplasmic reticulum, catalyzes the final step in thesn-glycerol-3-phosphate pathway leading to triacylglycerol.Although DGAT has been cloned from a variety of species, including the major oilseed crop of Canada, canola (Brassica napus), little is known about the structure/function of the enzyme.BnDGATl is the major isoform of type I DGAT (DGAT-1) in microspore-derived cell suspension cultures of B. napus L. cv Jet Neuf, with the possible existence of a truncated form of BnDGATl known as BnDGAT2.In order to gain some insight into the topology of the enzyme, type I DGAT from B. napus was investigated using two approaches: (1) in vitro translation in the presence of microsomes and (2) immunochemical analyses of microsomes isolated from cell suspension cultures, both in combination with proteolytic mapping.Difficulties were encountered with the in vitro translation approach, possibly due to proper incorporation of the polypeptide into microsomal vesicles.Two cytosolic regions were identified in BnDGATl, and one cytosolic region in putative BnDGAT2, using the immunochemical approach, thus providing some insight into the topology of B. napus DGAT-I.The results here support and nine and eight membrane-spanning topology for BnDGATl and BnDGAT2, respectively.iii I have many individuals to thank for their support and feedback throughout my masters program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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