Mucosal Barrier Depletion and Loss of Bacterial Diversity are Primary Abnormalities in Paediatric Ulcerative Colitis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND AIMS: Ulcerative colitis [UC] is associated with colonic mucosa barrier defects and bacterial dysbiosis, but these features may simply be the result of inflammation. Therefore, we sought to assess whether these features are inherently abrogated in the terminal ileum [TI] of UC patients, where inflammation is absent. METHODS: TI biopsies from paediatric inflammatory bowel disease [IBD] subsets [Crohn's disease [CD; n = 13] and UC [n = 10]], and non-IBD disease controls [n = 12] were histologically graded, and alcian blue/periodic acid-Schiff stained biopsies were quantified. The mucosal barrier was assessed for mucin [MUC2], immunoglobulin [Ig]A, IgG, and total bacteria (fluorescence in-situ hybridisation [FISH probe EUB338]) by immunofluorescence. The regulation of mucin secretion was investigated by NLRP6 gene expression and immunofluorescence. The composition of the active mucosa-associated microbiota was explored by sequencing the 16S rRNA amplicon generated from total RNA. RESULTS: Despite the absence of ileitis, UC patients displayed ileal barrier depletion illustrated by reductions in mucin-containing goblet cells and mucin production and altered epithelial NLRP6 expression. In both CD patients with ileitis and UC patients with normal histology, bacteria coated with IgA and IgG penetrated the TI mucin layer. Biopsy 16S rRNA sequencing revealed a reduction in α-diversity by three methods [Shannon, Simpson, and Equitability indices] between UC and non-IBD paediatric patients. CONCLUSIONS: These findings suggest an underlying defect in the UC-afflicted intestinal tract even in the absence of inflammation, implicating barrier and microbial changes as primary abnormalities in UC that may play a causative role in disease development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».