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Enregistrement W2212036227

Regulation of ubiquitous expression of the human growth hormone receptor (hGHR) gene

2007· article· en· W2212036227 sur OpenAlexaff
Gurvinder Kenth, Cynthia G. Goodyer

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonBiologyAlternative splicingGeneUntranslated regionGrowth hormone receptorCpG sitePromoterGeneticsCancerCancer researchMolecular biologyGene expressionMessenger RNADNA methylationEndocrinologyGrowth hormoneHormone
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AACR Annual Meeting-- Apr 14-18, 2007; Los Angeles, CA 4389 Growth hormone (hGH) is known to play an essential role in normal growth and metabolism but has also been associated with the progression of several cancers (e.g. breast, colon, prostate), often linked with increased expression of its receptor (hGHR) and IGF-I. Our research goal is to characterise the mechanism(s) regulating hGHR expression as the first step towards determining what causes its aberrant production in cancer tissues. The hGHR gene has a complex 5’untranslated region (5’UTR): fourteen variant mRNAs are expressed from different 5’UTR exons but all splice into the same site upstream of the translation start site and, thus, code for the same protein. Seven of these exons are clustered within two small regions: V2-V9-V3 (Module A) and V7-V1-V4-V8 (Module B). Module A-derived mRNAs are ubiquitously expressed while those from Module B are expressed in a tissue-, tumor- and developmental-specific fashion (only in normal postnatal liver), indicating that at least two different regulatory mechanisms are involved. One striking difference is that Module A promoters contain response elements (REs) for factors common amongst ubiquitously expressed genes, while Module B contains REs for liver-enriched factors. Secondly, CpG islands surround all three exons of Module A but not Module B. These differential features are conserved in the ovine, bovine, mouse and rat GHR genes. Studies of proximal promoter regions for Module A exons showed significant activity in HEK293, CV1, HepG2 and Huh7 cell lines. However, when the constructs were partially or fully methylated there was partial or complete loss of promoter activity, respectively. The methylation status of the promoter regions was examined in genomic DNA of two hepatoma cell lines (HepG2, Huh7) as well as human adult and fetal livers. Southern blot analyses for V2 and V9 showed partial methylation in fetal liver (in which hGHR levels are less abundant compared to adult liver), suggesting that expression of the ubiquitous hGHR mRNAs may be regulated by a methylation-specific mechanism. A second unique feature of Module A is that the promoter regions of each exon have a putative Sp1 binding site. Overexpression of a dominant-negative Sp1 in HEK293 cells showed a significant decrease in promoter activity for all three exons. Parallel experiments in drosophila SL2 cells indicate that overexpression of Sp1 or Sp3 has a stimulatory effect, primarily on a site within the V2 exon. Currently, Sp1 RE deletion and EMSA assays are being done to confirm which Sp1 sites play a significant role in regulating expression of the ubiquitous hGHR mRNAs. In summary, this study highlights important elements involved in regulating ubiquitous expression of the hGHR and, thus, sensitivity to hGH. This is a first step towards understanding aberrant expression of hGHR in cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
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