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Enregistrement W2213870681 · doi:10.1139/gen-2015-0044

Molecular mapping of five soybean genes involved in male-sterility, female-sterility

2015· article· en· W2213870681 sur OpenAlexvenueno aff
Benjamin Speth, Joshua Rogers, Napatsakorn Boonyoo, A.J. VanMeter, Jordan Baumbach, Alina Ott, Jerott Moore, Tyler Cina, Reid G. Palmer, Devinder Sandhu

Notice bibliographique

RevueGenome · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Undergraduate Education
Mots-clésBiologyGeneticsSterilityGeneChromosomeGenetic linkageMutantGene mapping

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In soybean, asynaptic and desynaptic mutants lead to abnormal meiosis and fertility reduction. Several male-sterile, female-sterile mutants have been identified and studied in soybean, however, some of these mutants have not been mapped to locations on soybean chromosomes. The objectives of this study were to molecularly map five male-sterile, female-sterile genes (st2, st4, st5, st6, and st7) in soybean and compare the map locations of these genes with already mapped sterility genes. Microsatellite markers were used in bulked segregant analyses to locate all five male-sterile, female-sterile genes to soybean chromosomes, and markers from the corresponding chromosomes were used on F2 populations to generate genetic linkage maps. The st2, st4, st5, st6, and st7 genes were located on molecular linkage group (MLG) B1 (chromosome 11), MLG D1a (chromosome 01), MLG F (chromosome 13), MLG B2 (chromosome 14), and D1b (chromosome 02), respectively. The st2, st4, st5, st6, and st7 genes were flanked to 10.3 (∼ 399 kb), 6.3 (∼ 164 kb), 3.9 (∼ 11.8 Mb), 11.0 (∼ 409 kb), and 5.3 cM (∼ 224 kb), and the flanked regions contained 57, 17, 362, 52, and 17 predicted genes, respectively. Future characterization of candidate genes should facilitate identification of the male- and female-fertility genes, which may provide vital insights on structure and function of genes involved in the reproductive pathway in soybean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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