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Enregistrement W2213940523 · doi:10.1186/s12870-015-0638-7

Changes in hormone flux and signaling in white spruce (Picea glauca) seeds during the transition from dormancy to germination in response to temperature cues

2015· article· en· W2213940523 sur OpenAlexafffund
Yang Liu, Kerstin Müller, Yousry A. El‐Kassaby, Allison R. Kermode

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean Commission
Mots-clésGerminationBiologyDormancyAbscisic acidSeed dormancyPlant hormoneGibberellinBotanyBlack spruceAuxinHorticultureTaigaGeneBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Seeds use environmental cues such as temperature to coordinate the timing of their germination, allowing plants to synchronize their life history with the seasons. Winter chilling is of central importance to alleviate seed dormancy, but very little is known of how chilling responses are regulated in conifer seeds. White spruce (Picea glauca) is an important conifer species of boreal forests in the North American taiga. The recent sequencing and assembly of the white spruce genome allows for comparative gene expression studies toward elucidating the molecular mechanisms governing dormancy alleviation by moist chilling. Here we focused on hormone metabolite profiling and analyses of genes encoding components of hormone signal transduction pathways, to elucidate changes during dormancy alleviation and to help address how germination cues such as temperature and light trigger radicle emergence. RESULTS: ABA, GA, and auxin underwent considerable changes as seeds underwent moist chilling and during subsequent germination; likewise, transcripts encoding hormone-signaling components (e.g. ABI3, ARF4 and Aux/IAA) were differentially regulated during these critical stages. During moist chilling, active IAA was maintained at constant levels, but IAA conjugates (IAA-Asp and IAA-Glu) were substantially accumulated. ABA concentrations decreased during germination of previously moist-chilled seeds, while the precursor of bioactive GA1 (GA53) accumulated. We contend that seed dormancy and germination may be partly mediated through the changing hormone concentrations and a modulation of interactions between central auxin-signaling pathway components (TIR1/AFB, Aux/IAA and ARF4). In response to germination cues, namely exposure to light and to increased temperature: the transfer of seeds from moist-chilling to 30 °C, significant changes in gene transcripts and protein expression occurred during the first six hours, substantiating a very swift reaction to germination-promoting conditions after seeds had received sufficient exposure to the chilling stimulus. CONCLUSIONS: The dormancy to germination transition in white spruce seeds was correlated with changes in auxin conjugation, auxin signaling components, and potential interactions between auxin-ABA signaling cascades (e.g. the transcription factor ARF4 and ABI3). Auxin flux adds a new dimension to the ABA:GA balance mechanism that underlies both dormancy alleviation by chilling, and subsequent radicle emergence to complete germination by warm temperature and light stimuli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,952
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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