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Enregistrement W2214181924 · doi:10.1128/jcm.03019-15

Multilaboratory Evaluation of <i>In Vitro</i> Antifungal Susceptibility Testing of Dermatophytes for ME1111

2015· article· en· W2214181924 sur OpenAlexaff
Mahmoud A. Ghannoum, Vishnu Chaturvedi, Daniel J. Diekema, Luis Ostrosky‐Zeichner, Robert Rennie, Thomas J. Walsh, Nancy L. Wengenack, Annette W. Fothergill, Nathan P. Wiederhold

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNail Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Alberta HospitalAlberta Hospital Edmonton
Organismes subventionnairesMeiji Seika Pharma
Mots-clésAntifungalMicrobiologyDermatophyteIn vitroBiologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ME1111 is a novel small molecule antifungal agent under development for the topical treatment of onychomycosis. Standardization of the susceptibility testing method for this candidate antifungal is needed. Toward this end, 8 independent laboratories determined the interlaboratory reproducibility of ME1111 susceptibility testing. In addition, we subsequently identified 2 strains as quality control (QC) isolates for the method. In the reproducibility study, 5 blinded clinical strains each of Trichophyton rubrum, Trichophyton mentagrophytes, and Epidermophyton floccosum were tested, while the QC study tested 6 blinded T. rubrum or T. mentagrophytes ATCC strains. Testing was performed in frozen microtiter panels according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M38-A2 methodology. In the reproducibility study, 9 of 15 clinical strains showed interlaboratory agreement of >90% at the 80% inhibition endpoint, with a range of agreement of 76.2% to 100%. In the QC study, 4 of the 6 ATCC strains showed interlaboratory agreement of >90%. ME1111 demonstrated excellent interlaboratory agreement when tested against dermatophytes. Based on this data, the CLSI Subcommittee on Antifungal Susceptibility Tests approved the susceptibility testing of ME1111 against dermatophytes according to M38-A2 methodology, which stipulates RPMI 1640 as the test medium, an inoculum size of 1 to 3 × 10(3) CFU/ml, and an incubation time and temperature of 96 h at 35°C. The MIC endpoint should be 80% inhibition compared with the growth control. T. rubrum ATCC MYA-4438 and T. mentagrophytes ATCC 28185 were selected as QC isolates, with an acceptable range of 0.12 to 1 μg/ml for the two strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,030
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0300,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,219
Tête enseignante GPT0,465
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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