Development of a genetic linkage map for Sharon goatgrass (<i>Aegilops sharonensis</i>) and mapping of a leaf rust resistance gene
Notice bibliographique
Résumé
Aegilops sharonensis (Sharon goatgrass), a diploid wheat relative, is known to be a rich source of disease resistance genes for wheat improvement. To facilitate the transfer of these genes into wheat, information on their chromosomal location is important. A genetic linkage map of Ae. sharonensis was constructed based on 179 F2 plants derived from a cross between accessions resistant (1644) and susceptible (1193) to wheat leaf rust. The linkage map was based on 389 markers (377 Diversity Arrays Technology (DArT) and 12 simple sequence repeat (SSR) loci) and was comprised of 10 linkage groups, ranging from 2.3 to 124.6 cM. The total genetic length of the map was 818.0 cM, with an average interval distance between markers of 3.63 cM. Based on the chromosomal location of 115 markers previously mapped in wheat, the four linkage groups of A, B, C, and E were assigned to Ae. sharonensis (S(sh)) and homoeologous wheat chromosomes 6, 1, 3, and 2. The single dominant gene (designated LrAeSh1644) conferring resistance to leaf rust race THBJ in accession 1644 was positioned on linkage group A (chromosome 6S(sh)) and was flanked by DArT markers wpt-9881 (at 1.9 cM distal from the gene) and wpt-6925 (4.5 cM proximal). This study clearly demonstrates the utility of DArT for genotyping uncharacterized species and tagging resistance genes where pertinent genomic information is lacking.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».