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Enregistrement W2215470554 · doi:10.1242/jeb.205.11.1625

Differential expression of mitochondria-encoded genes in a hibernating mammal

2002· article· en· W2215470554 sur OpenAlexaff
Dustin S. Hittel, Kenneth B. Storey

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHibernation (computing)Differential displayMitochondrionATP synthaseGround squirrelDownregulation and upregulationGene expressionCytochrome c oxidaseKidneyGeneSkeletal muscleMolecular biologyMessenger RNAInternal medicineEndocrinologyCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A cDNA library constructed from kidney of the thirteen-lined squirrel, Spermophilus tridecemlineatus, was differentially screened for genes that were upregulated during hibernation. A clone encoding cytochrome c oxidase subunit 1 was found and confirmed to have been upregulated by northern blotting. Differential expression of Cox1 mRNA occurred in multiple organs during hibernation; in hibernating animals transcript levels were twofold higher in kidney and fourfold higher in heart and brown adipose tissue than in euthermic animals, but were unchanged in skeletal muscle. Transcript levels of mitochondrial-encoded ATP synthase 6/8 were similarly upregulated in these tissues whereas transcript levels of the nuclear encoded subunits Cox4 and ATP synthase alpha did not change during hibernation. Immunoblot analysis revealed a 2.4-fold increase in Cox 1 protein and a slight decrease in Cox 4 protein in kidney of hibernating squirrels, compared with euthermic controls. Hibernating mammals may increase the expression of the mitochondrial genome in general, and Cox1 specifically, to prevent or minimize the damage to the electron transport chain caused by the cold and ischemia experienced during a hibernation bout.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,655

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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