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Enregistrement W2215904362 · doi:10.1371/journal.pone.0145688

Thermostabilization of the Human Serotonin Transporter in an Antidepressant-Bound Conformation

2015· article· en· W2215904362 sur OpenAlexfundno aff
Evan M. Green, Jonathan A. Coleman, Eric Gouaux

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthGovernment of CanadaNational Institute of Mental HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésSerotonin transporterSerotonergicSerotonin Plasma Membrane Transport ProteinsReuptakeTransporterSerotoninThermostabilitySolute carrier familyReuptake inhibitorBiologyAntidepressantChemistryBiophysicsPharmacologyBiochemistryReceptorNeuroscienceHippocampusEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serotonin is a ubiquitous chemical transmitter with particularly important roles in the gastrointestinal, cardiovascular and central nervous systems. Modulation of serotonergic signaling occurs, in part, by uptake of the transmitter by the serotonin transporter (SERT). In the brain, SERT is the target for numerous antidepressants including tricyclic antidepressants and selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs). Despite the importance of SERT in human physiology, biochemical, biophysical and high-resolution structural studies have been hampered due to the instability of SERT in detergent micelles. To identify a human SERT (hSERT) construct suitable for detailed biochemical and structural studies, we developed an efficient thermostability screening protocol and rapidly screened 219 mutations for thermostabilization of hSERT in complex with the SSRI paroxetine. We discovered three mutations-Y110A, I291A and T439S -that, when combined into a single construct, deemed TS3, yielded a hSERT variant with an apparent melting temperature (Tm) 19°C greater than that of the wild-type transporter, albeit with a loss of transport activity. Further investigation yielded a double mutant-I291A and T439S-defined as TS2, with a 12°C increase in Tm and retention of robust transport activity. Both TS2 and TS3 were more stable in short-chain detergents in comparison to the wild-type transporter. This thermostability screening protocol, as well as the specific hSERT variants, will prove useful in studies of other integral membrane receptors and transporters and in the investigation of structure and function relationships in hSERT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,157

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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